40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen2424_1016 on replicon NC_008542
Organism: Burkholderia cenocepacia HI2424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008542  Bcen2424_1016  hypothetical protein  100 
 
 
236 aa  475  1e-133  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0537  hypothetical protein  100 
 
 
236 aa  475  1e-133  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0975  hypothetical protein  97.88 
 
 
236 aa  426  1e-118  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0629475 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0879  hypothetical protein  91.95 
 
 
233 aa  400  1e-111  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0891  hypothetical protein  90.68 
 
 
233 aa  396  1e-109  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4127  hypothetical protein  93.69 
 
 
232 aa  381  1e-105  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.272713  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2379  hypothetical protein  87.5 
 
 
236 aa  361  5.0000000000000005e-99  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.323215  normal  0.696476 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2981  putative lipoprotein  70.59 
 
 
237 aa  324  9e-88  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2921  putative lipoprotein  71.11 
 
 
237 aa  317  1e-85  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.959785  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0465  putative lipoprotein  70.67 
 
 
237 aa  315  5e-85  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0709301  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0163  putative lipoprotein  70.67 
 
 
237 aa  315  5e-85  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.447071  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0984  putative lipoprotein  70.67 
 
 
237 aa  315  5e-85  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2612  putative lipoprotein  70.67 
 
 
237 aa  315  5e-85  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3027  putative lipoprotein  70.67 
 
 
237 aa  315  5e-85  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3067  putative transmembrane lipoprotein  64.95 
 
 
234 aa  259  2e-68  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0924  putative transmembrane lipoprotein  64.5 
 
 
234 aa  256  1e-67  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.132488  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0687  putative transmembrane lipoprotein  60.17 
 
 
233 aa  248  5e-65  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2124  lipoprotein transmembrane  46.39 
 
 
213 aa  154  1e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.167848  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1941  lipoprotein transmembrane  42.98 
 
 
222 aa  150  2e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.418069  normal  0.0186336 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2264  putative lipoprotein transmembrane  46.19 
 
 
222 aa  147  1.0000000000000001e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0186714  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2442  lipoprotein transmembrane  41.33 
 
 
223 aa  130  2.0000000000000002e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0877  hypothetical protein  42.59 
 
 
216 aa  124  2e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1514  hypothetical protein  34.3 
 
 
233 aa  80.5  0.00000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4994  putative lipoprotein  31.36 
 
 
214 aa  72.8  0.000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.2547  hitchhiker  0.00226373 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2635  putative lipoprotein  33.15 
 
 
201 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1458  putative lipoprotein  32.02 
 
 
205 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0424  putative lipoprotein  32.02 
 
 
205 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1667  putative lipoprotein  32.02 
 
 
205 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.801077  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1689  putative lipoprotein  32.02 
 
 
205 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.951198  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1844  putative lipoprotein  32.02 
 
 
205 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.331282  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0739  putative lipoprotein  32.02 
 
 
205 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0925  putative lipoprotein  32.02 
 
 
205 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1658  putative lipoprotein  28.57 
 
 
214 aa  65.9  0.0000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0879001 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0589  hypothetical protein  26.07 
 
 
232 aa  55.8  0.0000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.29516  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4583  hypothetical protein  25.44 
 
 
204 aa  54.7  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0957  hypothetical protein  25.82 
 
 
204 aa  52  0.000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.247971  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1439  hypothetical protein  25.82 
 
 
204 aa  52  0.000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.166739  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1417  hypothetical protein  25.82 
 
 
204 aa  51.2  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1358  hypothetical protein  29.21 
 
 
204 aa  50.8  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.234925  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1876  hypothetical protein  25.28 
 
 
204 aa  43.9  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0318105 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>