21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_2739 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012669  Bcav_2739  PilT protein domain protein  100 
 
 		 136 aa  271  2.0000000000000002e-72  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.517904  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00062  PIN domain, putative  37.88 
 
 		 136 aa  101  3e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0134903  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0447  PilT protein-like  35.61 
 
 		 135 aa  88.2  4e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.162759  normal  0.289411 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1364  hypothetical protein  34.07 
 
 		 134 aa  83.2  0.000000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2595  PilT domain-containing protein  36.43 
 
 		 132 aa  82.8  0.000000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.528946  normal  0.129291 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2684  PilT protein domain protein  35.66 
 
 		 132 aa  82  0.000000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.285595  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1920  PilT protein  33.33 
 
 		 133 aa  80.9  0.000000000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.192061  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2132  PilT protein-like  32.58 
 
 		 133 aa  80.1  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0313622  normal  0.0299917 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2562  PilT domain-containing protein  37.98 
 
 		 135 aa  79.7  0.00000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.828362  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3514  PilT protein domain protein  35.88 
 
 		 138 aa  78.6  0.00000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.522496 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3221  hypothetical protein  32.58 
 
 		 134 aa  74.7  0.0000000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1457  PilT protein domain protein  27.91 
 
 		 135 aa  72  0.000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.767558  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1838  hypothetical protein  32.84 
 
 		 132 aa  72  0.000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0778721  normal  0.378658 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0226  hypothetical protein  34.07 
 
 		 132 aa  67.8  0.00000000005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0256  hypothetical protein  34.07 
 
 		 132 aa  67.8  0.00000000005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3219  putative nucleic acid-binding PilT-like protein  29.63 
 
 		 137 aa  60.1  0.000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.54607 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3256  nucleic acid-binding protein  27.78 
 
 		 163 aa  58.9  0.00000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2924  nucleic acid-binding protein  29.87 
 
 		 160 aa  58.5  0.00000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3167  PilT domain-containing protein  28.68 
 
 		 135 aa  57.4  0.00000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000731556  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1712  hypothetical protein  27.95 
 
 		 167 aa  51.2  0.000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3956  PilT domain-containing protein  30.6 
 
 		 135 aa  42.7  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.104147  normal  0.970496 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>