36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_2027 on replicon NC_008390
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010551  BamMC406_1896  hypothetical protein  97.04 
 
 		 406 aa  687    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2027  hypothetical protein  100 
 
 		 406 aa  756    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.402308  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5304  hypothetical protein  91.87 
 
 		 406 aa  627  1e-178  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.967801  normal  0.137738 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6083  helix-turn-helix, type 11  88.18 
 
 		 406 aa  616  1e-175  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.92562  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1994  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  88.18 
 
 		 406 aa  616  1e-175  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.739767  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2014  hypothetical protein  87.68 
 
 		 406 aa  606  9.999999999999999e-173  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.641848  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4115  hypothetical protein  77.09 
 
 		 406 aa  547  1e-154  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1282  hypothetical protein  82.51 
 
 		 406 aa  537  1e-151  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0406727  normal  0.439874 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6465  hypothetical protein  73.89 
 
 		 406 aa  526  1e-148  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.645 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0543  hypothetical protein  73.65 
 
 		 406 aa  510  1e-143  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.939754  normal  0.330299 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2054  hypothetical protein  76.85 
 
 		 406 aa  505  9.999999999999999e-143  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.594988  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5692  hypothetical protein  69.7 
 
 		 406 aa  502  1e-141  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2553  hypothetical protein  76.11 
 
 		 406 aa  498  1e-140  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3202  hypothetical protein  74.88 
 
 		 407 aa  499  1e-140  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.480784  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2341  hypothetical protein  73.15 
 
 		 406 aa  494  1e-139  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.159022 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2671  hypothetical protein  70.94 
 
 		 406 aa  489  1e-137  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0727774  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0354  hypothetical protein  67.8 
 
 		 413 aa  487  1e-136  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.856052  normal  0.784045 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1312  hypothetical protein  72.91 
 
 		 406 aa  483  1e-135  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0250798  normal  0.495238 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1331  putative transcriptional regulator, CadC  70.13 
 
 		 406 aa  484  1e-135  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.900244  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0024  hypothetical protein  74.14 
 
 		 406 aa  467  9.999999999999999e-131  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.199967 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1376  hypothetical protein  72.41 
 
 		 406 aa  452  1.0000000000000001e-126  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.379564  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3285  hypothetical protein  73.57 
 
 		 367 aa  443  1e-123  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0105724  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2027  peptidase cysteine peptidase active site  73.57 
 
 		 367 aa  443  1e-123  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.986285  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6460  hypothetical protein  65.59 
 
 		 406 aa  430  1e-119  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.678731  normal  0.843647 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0992  tetratricopeptide TPR_4  64.09 
 
 		 406 aa  417  9.999999999999999e-116  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4057  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  61.35 
 
 		 406 aa  410  1e-113  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2358  hypothetical protein  68.04 
 
 		 414 aa  378  1e-104  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.634476  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4849  tetratricopeptide TPR_4  64.94 
 
 		 407 aa  366  1e-100  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3151  tetratricopeptide TPR_4  62.27 
 
 		 419 aa  354  2e-96  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3200  TPR repeat-containing protein  59.6 
 
 		 406 aa  345  8.999999999999999e-94  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0081  tetratricopeptide TPR_4  61.14 
 
 		 408 aa  334  2e-90  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6319  Tetratricopeptide TPR_4  59.9 
 
 		 406 aa  330  2e-89  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0345  hypothetical protein  56.49 
 
 		 416 aa  251  1e-65  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3607  hypothetical protein  57.18 
 
 		 421 aa  239  5e-62  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0764463 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0374  hypothetical protein  56.74 
 
 		 414 aa  233  5e-60  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.103729  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0361  hypothetical protein  56.23 
 
 		 415 aa  224  3e-57  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0254485  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>