34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_1687 on replicon NC_008390
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008390  Bamb_1687  hypothetical protein  100 
 
 		 108 aa  226  1e-58  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0808  hypothetical protein  34.78 
 
 		 99 aa  67  0.00000000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3088  hypothetical protein  38.46 
 
 		 96 aa  66.2  0.0000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4509  cytosolic protein  34.88 
 
 		 95 aa  63.9  0.0000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.190159 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1810  hypothetical protein  33.71 
 
 		 96 aa  60.8  0.000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.977987  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11520  hypothetical protein  32.58 
 
 		 105 aa  58.9  0.00000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.407986  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3078  hypothetical protein  37.63 
 
 		 94 aa  58.5  0.00000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0995  hypothetical protein  28.71 
 
 		 106 aa  58.5  0.00000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000808008  n/a   
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4263  hypothetical protein  33.33 
 
 		 112 aa  57  0.00000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3805  hypothetical protein  36.56 
 
 		 94 aa  55.5  0.0000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.164513 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5303  hypothetical protein  33 
 
 		 103 aa  54.7  0.0000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0686913  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0800  hypothetical protein  33.75 
 
 		 92 aa  53.5  0.000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.662726  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11010  hypothetical protein  30.77 
 
 		 96 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4873  hypothetical protein  32.29 
 
 		 115 aa  51.6  0.000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0672  hypothetical protein  32.22 
 
 		 96 aa  50.4  0.000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1009  hypothetical protein  29.67 
 
 		 96 aa  50.4  0.000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3528  hypothetical protein  25 
 
 		 96 aa  47.4  0.00007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3650  hypothetical protein  29.67 
 
 		 98 aa  46.6  0.0001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.945616 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0880  hypothetical protein  32.94 
 
 		 106 aa  45.4  0.0002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.353091  normal  0.692775 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2619  hypothetical protein  30.61 
 
 		 100 aa  45.1  0.0003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.861714  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5985  hypothetical protein  32.22 
 
 		 99 aa  45.1  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3110  hypothetical protein  30.53 
 
 		 98 aa  44.7  0.0004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.276984  normal  0.0760064 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4084  hypothetical protein  34.78 
 
 		 109 aa  44.3  0.0006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000391482 
 
 
-
 
NC_004310  BR1278  hypothetical protein  33.71 
 
 		 94 aa  42.4  0.002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0196743  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1243  hypothetical protein  33.71 
 
 		 94 aa  42.4  0.002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.061357  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3948  hypothetical protein  30 
 
 		 94 aa  42  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.789075  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1913  hypothetical protein  34.44 
 
 		 94 aa  41.6  0.003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.602401  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4404  hypothetical protein  27.17 
 
 		 100 aa  41.2  0.005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.23521 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0481  phosphomannomutase  32.32 
 
 		 450 aa  40.8  0.007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00838826 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2008  hypothetical protein  31.18 
 
 		 99 aa  40.8  0.007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3671  hypothetical protein  25.77 
 
 		 97 aa  40.4  0.009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.13934  normal  0.728089 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3781  hypothetical protein  26.8 
 
 		 97 aa  40  0.01  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.162978 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4274  hypothetical protein  30 
 
 		 94 aa  40  0.01  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3473  hypothetical protein  26.8 
 
 		 97 aa  40  0.01  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.986946  normal  0.62016 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>