39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_1319 on replicon NC_008390
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008390  Bamb_1319  hypothetical protein  100 
 
 		 204 aa  404  1.0000000000000001e-112  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1358  hypothetical protein  97.55 
 
 		 204 aa  373  1e-102  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.234925  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1439  hypothetical protein  87.75 
 
 		 204 aa  337  9e-92  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.166739  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0957  hypothetical protein  87.75 
 
 		 204 aa  337  9e-92  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.247971  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1417  hypothetical protein  87.75 
 
 		 204 aa  335  2.9999999999999997e-91  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4583  hypothetical protein  86.76 
 
 		 204 aa  329  2e-89  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1876  hypothetical protein  83.33 
 
 		 204 aa  322  3e-87  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0318105 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1689  putative lipoprotein  67.49 
 
 		 205 aa  243  9.999999999999999e-64  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.951198  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1667  putative lipoprotein  67.49 
 
 		 205 aa  243  9.999999999999999e-64  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.801077  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0424  putative lipoprotein  67.49 
 
 		 205 aa  243  9.999999999999999e-64  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0739  putative lipoprotein  67.49 
 
 		 205 aa  243  9.999999999999999e-64  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1458  putative lipoprotein  67.49 
 
 		 205 aa  243  9.999999999999999e-64  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2635  putative lipoprotein  66.18 
 
 		 201 aa  243  9.999999999999999e-64  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1844  putative lipoprotein  67.49 
 
 		 205 aa  243  9.999999999999999e-64  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.331282  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0925  putative lipoprotein  67.49 
 
 		 205 aa  243  9.999999999999999e-64  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1658  putative lipoprotein  45.74 
 
 		 214 aa  143  2e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0879001 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4994  putative lipoprotein  43.92 
 
 		 214 aa  132  3.9999999999999996e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.2547  hitchhiker  0.00226373 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2442  lipoprotein transmembrane  32.97 
 
 		 223 aa  69.7  0.00000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2264  putative lipoprotein transmembrane  30 
 
 		 222 aa  58.5  0.00000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0186714  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1941  lipoprotein transmembrane  29.52 
 
 		 222 aa  58.5  0.00000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.418069  normal  0.0186336 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0687  putative transmembrane lipoprotein  26.37 
 
 		 233 aa  58.5  0.00000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2921  putative lipoprotein  30.89 
 
 		 237 aa  54.7  0.0000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.959785  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0975  hypothetical protein  28.31 
 
 		 236 aa  54.3  0.000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0629475 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0163  putative lipoprotein  29.5 
 
 		 237 aa  54.7  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.447071  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2612  putative lipoprotein  29.5 
 
 		 237 aa  54.7  0.000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2981  putative lipoprotein  29.32 
 
 		 237 aa  54.7  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0984  putative lipoprotein  29.5 
 
 		 237 aa  54.7  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3027  putative lipoprotein  29.5 
 
 		 237 aa  54.7  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0465  putative lipoprotein  29.5 
 
 		 237 aa  54.7  0.000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0709301  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2379  hypothetical protein  27.27 
 
 		 236 aa  53.5  0.000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.323215  normal  0.696476 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1016  hypothetical protein  25.88 
 
 		 236 aa  52.8  0.000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0537  hypothetical protein  25.88 
 
 		 236 aa  52.8  0.000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4127  hypothetical protein  26.54 
 
 		 232 aa  52.4  0.000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.272713  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3067  putative transmembrane lipoprotein  26.73 
 
 		 234 aa  51.6  0.000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0879  hypothetical protein  25.33 
 
 		 233 aa  50.4  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0891  hypothetical protein  25.33 
 
 		 233 aa  50.4  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0924  putative transmembrane lipoprotein  25.74 
 
 		 234 aa  49.3  0.00004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.132488  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2124  lipoprotein transmembrane  28.72 
 
 		 213 aa  47  0.0002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.167848  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0877  hypothetical protein  27.46 
 
 		 216 aa  47  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>