19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_0389 on replicon NC_008390
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008390  Bamb_0389  hypothetical protein  100 
 
 
292 aa  605  9.999999999999999e-173  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.546087  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2627  hypothetical protein  93.68 
 
 
311 aa  551  1e-156  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0478  hypothetical protein  93.68 
 
 
311 aa  551  1e-156  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0455  hypothetical protein  93.14 
 
 
306 aa  518  1e-146  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0416  hypothetical protein  79.5 
 
 
311 aa  477  1e-133  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.785538 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2912  hypothetical protein  78.75 
 
 
302 aa  450  1e-125  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2918  hypothetical protein  81.42 
 
 
568 aa  322  5e-87  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0414  hypothetical protein  59.19 
 
 
283 aa  310  1e-83  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.747582  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0477  hypothetical protein  57.93 
 
 
278 aa  302  6.000000000000001e-81  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2628  hypothetical protein  58.15 
 
 
270 aa  302  6.000000000000001e-81  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2911  hypothetical protein  58.65 
 
 
275 aa  300  1e-80  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2920  hypothetical protein  58.09 
 
 
283 aa  300  2e-80  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.548534  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2914  hypothetical protein  51.84 
 
 
281 aa  286  2e-76  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2910  hypothetical protein  52.08 
 
 
307 aa  286  2.9999999999999996e-76  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2915  hypothetical protein  54.09 
 
 
271 aa  278  5e-74  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0453  hypothetical protein  51.29 
 
 
276 aa  272  5.000000000000001e-72  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1591  hypothetical protein  31.75 
 
 
291 aa  42.4  0.009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1616  hypothetical protein  31.75 
 
 
291 aa  42.4  0.009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1772  hypothetical protein  31.75 
 
 
291 aa  42.4  0.009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.077291  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>