12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_6686 on replicon NC_010553
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010553  BamMC406_6686  fimbrial protein  100 
 
 		 342 aa  695    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.850094  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3015  fimbrial protein  76.09 
 
 		 343 aa  531  1e-150  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0133  fimbrial protein subfamily protein  49.71 
 
 		 377 aa  304  2.0000000000000002e-81  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.270625  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0169  hypothetical protein  50.43 
 
 		 342 aa  298  1e-79  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1618  hypothetical protein  50.43 
 
 		 342 aa  297  2e-79  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0147  hypothetical protein  50.14 
 
 		 342 aa  296  4e-79  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.1246  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0060  fimbrial adhesin precursor  27.18 
 
 		 354 aa  51.6  0.00002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.485498  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0564  Fimbrial protein  27.78 
 
 		 345 aa  52  0.00002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.648396 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0050  fimbrial protein  24.51 
 
 		 354 aa  49.3  0.0001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30690  hypothetical protein  26.71 
 
 		 351 aa  46.6  0.0006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000866279  hitchhiker  0.000842933 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0062  fimbrial adhesin precursor  27.32 
 
 		 348 aa  46.6  0.0006  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.571199  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3293  fimbrial protein  24.47 
 
 		 342 aa  45.8  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0241788 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>