26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_4825 on replicon NC_010552
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010552  BamMC406_4825  cupin 2 domain-containing protein  100 
 
 		 198 aa  397  9.999999999999999e-111  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5492  transcriptional regulator protein  70.74 
 
 		 193 aa  282  2.0000000000000002e-75  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2395  cupin 2 domain-containing protein  71.51 
 
 		 192 aa  280  9e-75  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.162048  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1938  hypothetical protein  69.4 
 
 		 191 aa  270  1e-71  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.73761  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3139  cupin 2 domain-containing protein  62.11 
 
 		 192 aa  255  3e-67  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3204  hypothetical protein  52.38 
 
 		 195 aa  203  2e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3537  cupin 2, barrel  43.01 
 
 		 193 aa  153  1e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.579632  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5297  cupin 2 domain-containing protein  45.56 
 
 		 183 aa  149  3e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4799  cupin 2 domain-containing protein  40.88 
 
 		 177 aa  120  9e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.49808  normal  0.0689271 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3987  cupin 2 domain-containing protein  37.43 
 
 		 164 aa  117  9.999999999999999e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.966145  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1347  hypothetical protein  38.64 
 
 		 176 aa  114  6.9999999999999995e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000000835036  hitchhiker  0.0000107341 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1682  hypothetical protein  38.76 
 
 		 186 aa  113  2.0000000000000002e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.557508  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4528  cupin 2 domain-containing protein  37.5 
 
 		 175 aa  105  5e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.42906  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1555  hypothetical protein  37.08 
 
 		 179 aa  102  4e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.401797 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3026  cupin 2 domain-containing protein  39.25 
 
 		 176 aa  96.7  2e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3421  cupin 2 domain-containing protein  35.16 
 
 		 171 aa  94.4  1e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.357216  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1200  cupin 2 domain-containing protein  35.16 
 
 		 183 aa  88.2  7e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.375289  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5607  cupin 2 domain-containing protein  36.31 
 
 		 183 aa  86.3  3e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.60204  normal  0.97721 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06743  hydrolase, CocE/NonD family, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G00600)  31.55 
 
 		 793 aa  69.3  0.00000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0144437 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07635  Putative uncharacterized proteinPutative uncharacterized protein binA ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:O74707]  54.1 
 
 		 144 aa  67  0.0000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.837301  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1171  hypothetical protein  26.9 
 
 		 162 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.355646 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1913  hypothetical protein  38.98 
 
 		 141 aa  44.7  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.421142  normal  0.261472 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4820  hypothetical protein  38.98 
 
 		 141 aa  44.3  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0707469  normal  1 
 
 
-
 
NC_006684  CNB05730  hypothetical protein  43.75 
 
 		 179 aa  43.5  0.002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.26234  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4917  XRE family transcriptional regulator  38 
 
 		 184 aa  42.4  0.004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5435  Cupin 2 conserved barrel domain protein  38.89 
 
 		 149 aa  41.6  0.007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.657648 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>