43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_0891 on replicon NC_010551
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010551  BamMC406_0891  hypothetical protein  100 
 
 		 233 aa  469  1.0000000000000001e-131  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0879  hypothetical protein  98.71 
 
 		 233 aa  465  9.999999999999999e-131  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0975  hypothetical protein  90.68 
 
 		 236 aa  402  1e-111  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0629475 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0537  hypothetical protein  91.44 
 
 		 236 aa  382  1e-105  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1016  hypothetical protein  91.44 
 
 		 236 aa  382  1e-105  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4127  hypothetical protein  94.06 
 
 		 232 aa  383  1e-105  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.272713  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2379  hypothetical protein  90.5 
 
 		 236 aa  369  1e-101  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.323215  normal  0.696476 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2981  putative lipoprotein  69.79 
 
 		 237 aa  323  1e-87  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2921  putative lipoprotein  71.43 
 
 		 237 aa  321  7e-87  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.959785  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0163  putative lipoprotein  70.98 
 
 		 237 aa  319  1.9999999999999998e-86  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.447071  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2612  putative lipoprotein  70.98 
 
 		 237 aa  319  1.9999999999999998e-86  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0984  putative lipoprotein  70.98 
 
 		 237 aa  319  1.9999999999999998e-86  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3027  putative lipoprotein  70.98 
 
 		 237 aa  319  1.9999999999999998e-86  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0465  putative lipoprotein  70.98 
 
 		 237 aa  319  1.9999999999999998e-86  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0709301  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3067  putative transmembrane lipoprotein  66.15 
 
 		 234 aa  265  2.9999999999999995e-70  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0924  putative transmembrane lipoprotein  66.16 
 
 		 234 aa  263  1e-69  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.132488  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0687  putative transmembrane lipoprotein  60.61 
 
 		 233 aa  248  7e-65  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1941  lipoprotein transmembrane  45.95 
 
 		 222 aa  156  2e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.418069  normal  0.0186336 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2264  putative lipoprotein transmembrane  45.78 
 
 		 222 aa  151  8.999999999999999e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0186714  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2124  lipoprotein transmembrane  48.17 
 
 		 213 aa  150  1e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.167848  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0877  hypothetical protein  43.19 
 
 		 216 aa  127  1.0000000000000001e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2442  lipoprotein transmembrane  40.72 
 
 		 223 aa  126  3e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1514  hypothetical protein  34 
 
 		 233 aa  80.5  0.00000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4994  putative lipoprotein  32.53 
 
 		 214 aa  73.6  0.000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.2547  hitchhiker  0.00226373 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2635  putative lipoprotein  33.15 
 
 		 201 aa  66.6  0.0000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1658  putative lipoprotein  29.48 
 
 		 214 aa  66.2  0.0000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0879001 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0739  putative lipoprotein  32.04 
 
 		 205 aa  63.2  0.000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0925  putative lipoprotein  32.04 
 
 		 205 aa  63.2  0.000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1844  putative lipoprotein  32.04 
 
 		 205 aa  63.2  0.000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.331282  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1689  putative lipoprotein  32.04 
 
 		 205 aa  63.2  0.000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.951198  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1667  putative lipoprotein  32.04 
 
 		 205 aa  63.2  0.000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.801077  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0424  putative lipoprotein  32.04 
 
 		 205 aa  63.2  0.000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1458  putative lipoprotein  32.04 
 
 		 205 aa  63.2  0.000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0589  hypothetical protein  28.11 
 
 		 232 aa  62  0.000000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.29516  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4583  hypothetical protein  27.56 
 
 		 204 aa  55.1  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0957  hypothetical protein  25.7 
 
 		 204 aa  50.8  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.247971  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1358  hypothetical protein  29.14 
 
 		 204 aa  50.8  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.234925  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1439  hypothetical protein  25.7 
 
 		 204 aa  50.8  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.166739  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1417  hypothetical protein  25.7 
 
 		 204 aa  50.1  0.00003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2339  hypothetical protein  25.96 
 
 		 217 aa  42.7  0.005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.039929  normal  0.763516 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2012  hypothetical protein  28.57 
 
 		 229 aa  42.4  0.007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.581961  normal  0.0111404 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1876  hypothetical protein  25.26 
 
 		 204 aa  42  0.008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0318105 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1114  hypothetical protein  24.31 
 
 		 209 aa  41.6  0.01  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>