12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_0009 on replicon NC_010551
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010551  BamMC406_0009  DNA sulfur modification protein DndE  100 
 
 		 128 aa  260  4e-69  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0741  hypothetical protein  54.13 
 
 		 119 aa  120  6e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0326582  normal  0.737644 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0173  DNA sulfur modification protein DndE  36.7 
 
 		 125 aa  89.4  2e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4844  DNA sulfur modification protein DndE  43.93 
 
 		 132 aa  80.1  0.000000000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.936461 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2476  hypothetical protein  29.75 
 
 		 132 aa  74.7  0.0000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0161397  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3762  hypothetical protein  36.54 
 
 		 128 aa  72.8  0.000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0617716 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2211  hypothetical protein  35.58 
 
 		 133 aa  71.6  0.000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2399  DNA sulfur modification protein DndE  37.5 
 
 		 130 aa  63.5  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2456  DNA sulfur modification protein DndE  37.5 
 
 		 130 aa  63.5  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0473019 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0831  hypothetical protein  30.28 
 
 		 126 aa  45.4  0.0003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0357  hypothetical protein  31 
 
 		 141 aa  43.9  0.0008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.178262 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1370  DNA sulfur modification protein DndE  31.68 
 
 		 138 aa  41.2  0.005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0297592  normal  0.728209 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>