22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BLD_1209 on replicon NC_010816
Organism: Bifidobacterium longum DJO10A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010816  BLD_1209  hypothetical protein  100 
 
 
209 aa  421  1e-117  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0098  hypothetical protein  56.77 
 
 
255 aa  221  8e-57  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.15256 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2425  orotate phosphoribosyltransferase  42.86 
 
 
191 aa  85.5  5e-16  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.205434 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2976  orotate phosphoribosyltransferase  33.7 
 
 
191 aa  84.3  0.000000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3147  orotate phosphoribosyltransferase  39.06 
 
 
192 aa  83.6  0.000000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35310  orotate phosphoribosyltransferase  40.48 
 
 
197 aa  80.9  0.00000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.238269  normal  0.306388 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01980  orotate phosphoribosyltransferase  30.06 
 
 
195 aa  63.9  0.000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0210  orotate phosphoribosyltransferase  32.41 
 
 
178 aa  61.6  0.000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3646  orotate phosphoribosyltransferase  30.86 
 
 
188 aa  60.8  0.00000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4631  orotate phosphoribosyltransferase  31.72 
 
 
177 aa  60.1  0.00000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.229004  normal  0.472051 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0512  orotate phosphoribosyltransferase  28.49 
 
 
194 aa  60.1  0.00000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2123  orotate phosphoribosyltransferase  38.04 
 
 
196 aa  58.5  0.00000007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0652  orotate phosphoribosyltransferase  28 
 
 
194 aa  57.4  0.0000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0394  Orotate phosphoribosyltransferase  34.27 
 
 
178 aa  54.3  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0181  orotate phosphoribosyltransferase  30.68 
 
 
178 aa  50.8  0.00001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3008  orotate phosphoribosyltransferase  30.34 
 
 
177 aa  48.1  0.00009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25780  orotate phosphoribosyltransferase  30.56 
 
 
199 aa  47  0.0002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05620  orotate phosphoribosyltransferase  37.89 
 
 
185 aa  46.2  0.0004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0920693  normal  0.821582 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0130  orotate phosphoribosyltransferase  34.78 
 
 
179 aa  45.4  0.0006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000251206 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0125  orotate phosphoribosyltransferase  33.7 
 
 
179 aa  44.7  0.001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5160  orotate phosphoribosyltransferase  25.9 
 
 
192 aa  43.5  0.003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6419  orotate phosphoribosyltransferase  28.28 
 
 
174 aa  42.7  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>