13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BCE_3478 on replicon NC_003909
Organism: Bacillus cereus ATCC 10987



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003909  BCE_3478  cytidine deaminase  100 
 
 		 142 aa  298  2e-80  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3426  cytidine deaminase  89.44 
 
 		 142 aa  274  2e-73  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3387  cytidine deaminase  89.44 
 
 		 142 aa  274  2e-73  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.274562  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3696  cytidine deaminase  89.44 
 
 		 142 aa  274  2e-73  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.398657  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3646  cytidine deaminase  89.44 
 
 		 142 aa  274  2e-73  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3338  cytidine deaminase  89.44 
 
 		 142 aa  273  6e-73  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3668  cytidine deaminase  88.73 
 
 		 142 aa  272  1.0000000000000001e-72  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0231868  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2140  cytidine deaminase  44.78 
 
 		 143 aa  115  1.9999999999999998e-25  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.621603  normal  0.187784 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3067  cytidine deaminase  28.8 
 
 		 130 aa  48.9  0.00003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00456588  decreased coverage  0.0000000642957 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0790  cytidine deaminase  24.76 
 
 		 132 aa  42  0.003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000426322  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6907  hypothetical protein  25.19 
 
 		 139 aa  42  0.003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.373552 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1286  cytidine deaminase, homotetrameric  26.67 
 
 		 149 aa  40.8  0.006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.887812  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3635  cytidine deaminase  24.53 
 
 		 142 aa  40.4  0.008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.825648 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>