31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_p0124 on replicon NC_009475
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009475  BBta_p0124  hypothetical protein  100 
 
 
204 aa  407  1e-113  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0220  hypothetical protein  62.11 
 
 
197 aa  206  2e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.231447 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0876  hypothetical protein  27.43 
 
 
330 aa  72.4  0.000000000004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.423577  normal  0.480034 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1360  hypothetical protein  27.53 
 
 
203 aa  63.2  0.000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.0205277 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2473  putative transmembrane protein  33.33 
 
 
216 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.578174  normal  0.940793 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4736  hypothetical protein  37.38 
 
 
239 aa  55.5  0.0000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.196854  normal  0.935032 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1632  putative transmembrane protein  36.9 
 
 
217 aa  54.3  0.000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.449297 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1575  hypothetical protein  38.78 
 
 
240 aa  54.3  0.000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1770  putative transmembrane protein  35.48 
 
 
220 aa  53.9  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1601  hypothetical protein  24.14 
 
 
196 aa  51.2  0.000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3017  hypothetical protein  25.73 
 
 
165 aa  51.2  0.00001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000243008  normal  0.0643153 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2483  hypothetical protein  34.31 
 
 
258 aa  50.8  0.00001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.292542  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1598  hypothetical protein  36.73 
 
 
239 aa  50.4  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1118  hypothetical protein  36.73 
 
 
239 aa  50.4  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1494  hypothetical protein  36.73 
 
 
240 aa  50.4  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1214  hypothetical protein  35.23 
 
 
244 aa  48.9  0.00005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0931852  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1639  hypothetical protein  36.14 
 
 
227 aa  48.9  0.00005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0803  hypothetical protein  35.23 
 
 
244 aa  48.9  0.00005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0358  hypothetical protein  35.23 
 
 
244 aa  48.9  0.00005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.240886  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1701  hypothetical protein  35.23 
 
 
244 aa  48.9  0.00005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.836141  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1514  hypothetical protein  34.94 
 
 
236 aa  47  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.875817  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1842  hypothetical protein  34.09 
 
 
244 aa  45.8  0.0004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1857  hypothetical protein  34.09 
 
 
244 aa  45.8  0.0005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.704387  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2011  hypothetical protein  34.09 
 
 
244 aa  45.8  0.0005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2602  hypothetical protein  25.48 
 
 
183 aa  45.1  0.0007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.524516  normal  0.221337 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5458  hypothetical protein  28.4 
 
 
184 aa  44.7  0.0009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5516  hypothetical protein  30.23 
 
 
202 aa  43.1  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.317091  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2187  hypothetical protein  23.86 
 
 
206 aa  42.4  0.005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5890  hypothetical protein  23.86 
 
 
206 aa  42.4  0.005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00765  hypothetical protein  25.58 
 
 
186 aa  42  0.006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.547305  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08311  hypothetical protein  26.51 
 
 
199 aa  42  0.006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000165507 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>