46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_5077 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_5077  hypothetical protein  100 
 
 		 407 aa  823    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.192036  normal  0.166404 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1535  monooxygenase, FAD-binding  57.37 
 
 		 398 aa  462  1e-129  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5587  monooxygenase FAD-binding  48.15 
 
 		 398 aa  347  3e-94  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0585344  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6617  monooxygenase FAD-binding  44.44 
 
 		 382 aa  334  2e-90  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.408018  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5388  monooxygenase FAD-binding  42.3 
 
 		 389 aa  258  1e-67  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1352  hypothetical protein  60.39 
 
 		 157 aa  209  7e-53  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.368178 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0142  hypothetical protein  32.11 
 
 		 374 aa  191  2e-47  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1353  hypothetical protein  45.83 
 
 		 97 aa  104  3e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.506771  normal  0.224738 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1354  hypothetical protein  63.01 
 
 		 108 aa  92.4  1e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.353424  normal  0.227575 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0777  2-octaprenyl-3-methyl-6-methoxy-1,4-benzoquinol hydroxylase  24.25 
 
 		 391 aa  58.5  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.000759163  normal  0.821116 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0716  2-octaprenyl-3-methyl-6-methoxy-1,4-benzoquinol hydroxylase  24.55 
 
 		 391 aa  58.5  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000335906  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2051  2-octaprenyl-6-methoxyphenol hydroxylase  24.12 
 
 		 409 aa  58.5  0.0000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0991465  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0685  2-octaprenyl-3-methyl-6-methoxy-1,4-benzoquinol hydroxylase  29.48 
 
 		 391 aa  56.6  0.0000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00002921  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2983  2-octaprenyl-3-methyl-6-methoxy-1,4-benzoquinol hydroxylase  29.48 
 
 		 391 aa  56.2  0.000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000000743082  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0789  2-octaprenyl-3-methyl-6-methoxy-1,4-benzoquinol hydroxylase  24.25 
 
 		 391 aa  56.2  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.129538  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0585  2-octaprenyl-3-methyl-6-methoxy-1,4-benzoquinol hydroxylase  29.48 
 
 		 391 aa  55.8  0.000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000156374  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0709  2-octaprenyl-3-methyl-6-methoxy-1,4-benzoquinol hydroxylase  29.48 
 
 		 391 aa  55.5  0.000002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000850111  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00630  2-octaprenyl-3-methyl-6-methoxy-1,4-benzoquinol hydroxylase  29.48 
 
 		 391 aa  55.5  0.000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000612482  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00621  hypothetical protein  29.48 
 
 		 391 aa  55.5  0.000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00122324  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2964  Ubiquinone biosynthesis hydroxylase, UbiH/UbiF/VisC/COQ6 family  29.48 
 
 		 391 aa  55.5  0.000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000940784  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0825  2-octaprenyl-3-methyl-6-methoxy-1,4-benzoquinol hydroxylase  24.25 
 
 		 391 aa  54.7  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00167325  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0692  2-octaprenyl-3-methyl-6-methoxy-1,4-benzoquinol hydroxylase  27.08 
 
 		 391 aa  54.7  0.000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000811141  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0730  2-octaprenyl-3-methyl-6-methoxy-1,4-benzoquinol hydroxylase  24.25 
 
 		 391 aa  53.5  0.000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.11675  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0756  2-octaprenyl-3-methyl-6-methoxy-1,4-benzoquinol hydroxylase  28.9 
 
 		 391 aa  53.1  0.000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000354317  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002485  2-octaprenyl-3-methyl-6-methoxy-1,4-benzoquinol hydroxylase  25.38 
 
 		 402 aa  49.3  0.0001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00306134  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0817  UbiH/UbiF/VisC/COQ6 family ubiquinone biosynthesis hydroxylase  24.51 
 
 		 411 aa  48.5  0.0002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0219172  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2537  2-octaprenyl-6-methoxyphenol hydroxylase  23.2 
 
 		 401 aa  48.1  0.0003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1640  2-octaprenyl-6-methoxyphenyl hydroxylase  26.47 
 
 		 403 aa  47.8  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.571236  normal  0.32038 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1221  2-octaprenyl-3-methyl-6-methoxy-1,4-benzoquinol hydroxylase  26.13 
 
 		 413 aa  47.8  0.0004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000618146  normal  0.0196458 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5197  2-octaprenyl-3-methyl-6-methoxy-1,4-benzoquinol hydroxylase  25.56 
 
 		 407 aa  47  0.0005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5199  2-octaprenyl-6-methoxyphenyl hydroxylase  25.88 
 
 		 399 aa  46.6  0.0009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.539289  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5106  2-octaprenyl-6-methoxyphenyl hydroxylase  25.88 
 
 		 399 aa  46.2  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.113961  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1827  2-octaprenyl-6-methoxyphenyl hydroxylase  25.45 
 
 		 403 aa  46.2  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0573  2-octaprenyl-6-methoxyphenyl hydroxylase  29.17 
 
 		 452 aa  45.8  0.001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02229  2-octaprenyl-3-methyl-6-methoxy-1,4-benzoquinol hydroxylase  24.1 
 
 		 399 aa  45.8  0.001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2854  UbiH/UbiF/VisC/COQ6 family ubiquinone biosynthesis hydroxylase  24.43 
 
 		 413 aa  45.8  0.001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000692604  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0539  2-octaprenyl-6-methoxyphenyl hydroxylase  29.17 
 
 		 452 aa  45.8  0.001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5259  2-octaprenyl-6-methoxyphenyl hydroxylase  25.6 
 
 		 399 aa  45.8  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03549  2-octaprenyl-6-methoxyphenol hydroxylase  22.46 
 
 		 402 aa  45.8  0.002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2670  UbiH/UbiF/VisC/COQ6 family ubiquinone biosynthesis hydroxylase  26.42 
 
 		 419 aa  45.1  0.002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.694868 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0816  2-octaprenyl-6-methoxyphenyl hydroxylase  22.42 
 
 		 404 aa  45.1  0.002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0931067  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3133  2-octaprenyl-3-methyl-6-methoxy-1,4-benzoquinol hydroxylase  27.34 
 
 		 388 aa  45.1  0.002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.113474  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3635  2-octaprenyl-6-methoxyphenyl hydroxylase  28.19 
 
 		 414 aa  45.4  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1183  oxidoreductase, FAD-binding  23.26 
 
 		 404 aa  43.9  0.006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3512  2-octaprenyl-6-methoxyphenol hydroxylase / 2-octaprenyl-3-methyl-6-methoxy-1,4-benzoquinol hydroxylase  35.79 
 
 		 438 aa  43.1  0.008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.418598  normal  0.690858 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5257  2-octaprenyl-3-methyl-6-methoxy-1,4-benzoquinol hydroxylase  23.98 
 
 		 407 aa  43.1  0.01  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>