26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_1938 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_1938  hypothetical protein  100 
 
 		 191 aa  389  1e-107  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.73761  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2395  cupin 2 domain-containing protein  70.59 
 
 		 192 aa  281  6.000000000000001e-75  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.162048  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4825  cupin 2 domain-containing protein  69.4 
 
 		 198 aa  270  9e-72  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5492  transcriptional regulator protein  66.85 
 
 		 193 aa  252  2.0000000000000002e-66  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3139  cupin 2 domain-containing protein  63.74 
 
 		 192 aa  245  2e-64  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3204  hypothetical protein  53.85 
 
 		 195 aa  199  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3537  cupin 2, barrel  48.62 
 
 		 193 aa  165  2.9999999999999998e-40  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.579632  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5297  cupin 2 domain-containing protein  44.51 
 
 		 183 aa  149  3e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1682  hypothetical protein  40.98 
 
 		 186 aa  123  2e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.557508  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3987  cupin 2 domain-containing protein  39.43 
 
 		 164 aa  120  9.999999999999999e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.966145  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4799  cupin 2 domain-containing protein  37.43 
 
 		 177 aa  113  2.0000000000000002e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.49808  normal  0.0689271 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1347  hypothetical protein  38.55 
 
 		 176 aa  112  4.0000000000000004e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000000835036  hitchhiker  0.0000107341 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3421  cupin 2 domain-containing protein  40.33 
 
 		 171 aa  99.8  2e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.357216  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4528  cupin 2 domain-containing protein  35.14 
 
 		 175 aa  98.2  6e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.42906  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1555  hypothetical protein  34.86 
 
 		 179 aa  97.8  7e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.401797 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1200  cupin 2 domain-containing protein  34.1 
 
 		 183 aa  80.5  0.00000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.375289  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3026  cupin 2 domain-containing protein  35.71 
 
 		 176 aa  80.9  0.00000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5607  cupin 2 domain-containing protein  33.52 
 
 		 183 aa  74.7  0.0000000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.60204  normal  0.97721 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07635  Putative uncharacterized proteinPutative uncharacterized protein binA ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:O74707]  53.85 
 
 		 144 aa  72.4  0.000000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.837301  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06743  hydrolase, CocE/NonD family, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G00600)  31.58 
 
 		 793 aa  71.2  0.000000000008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0144437 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1171  hypothetical protein  28.65 
 
 		 162 aa  70.9  0.00000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.355646 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4820  hypothetical protein  43.1 
 
 		 141 aa  53.5  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0707469  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1913  hypothetical protein  41.54 
 
 		 141 aa  52.8  0.000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.421142  normal  0.261472 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3009  hypothetical protein  38.18 
 
 		 241 aa  48.1  0.00008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006684  CNB05730  hypothetical protein  43.4 
 
 		 179 aa  45.8  0.0004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.26234  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB04830  hypothetical protein  31.15 
 
 		 195 aa  45.8  0.0004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>