72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_0438 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009485  BBta_0438  putative transposase  100 
 
 
98 aa  197  3.9999999999999996e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.506207 
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6425  transposase mutator type  54.08 
 
 
422 aa  105  2e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2156  transposase, mutator type  48.98 
 
 
417 aa  104  5e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0191719  normal  0.0398782 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2616  transposase mutator type  52.04 
 
 
422 aa  103  8e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.938771  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1721  transposase, mutator type  48.98 
 
 
417 aa  102  2e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1122  transposase mutator type  52.04 
 
 
422 aa  102  2e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.370591  normal  0.143118 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0049  transposase mutator type  52.04 
 
 
422 aa  102  2e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3955  transposase, mutator type  45.92 
 
 
417 aa  98.2  3e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2799  transposase, mutator type  45.92 
 
 
417 aa  98.2  3e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.855527  n/a   
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0186  transposase mutator type  45.92 
 
 
424 aa  97.8  5e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.183961 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2717  transposase mutator type  45.92 
 
 
424 aa  97.4  5e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.875305  hitchhiker  0.000051751 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3096  transposase mutator type  45.92 
 
 
424 aa  97.8  5e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.312231  normal 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0005  transposase mutator type  45.92 
 
 
424 aa  97.8  5e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0038  transposase mutator type  45.92 
 
 
424 aa  97.8  5e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0135  transposase mutator type  45.92 
 
 
424 aa  97.8  5e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3976  transposase, mutator type  45.92 
 
 
222 aa  97.4  6e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.571911  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4297  transposase, mutator type  48.45 
 
 
376 aa  96.7  9e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.799563  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3201  transposase, mutator type  45.92 
 
 
415 aa  93.6  7e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0375462  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2146  transposase, mutator type  45.92 
 
 
415 aa  93.6  7e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1631  transposase, mutator type  45.92 
 
 
415 aa  93.6  7e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0295  transposase  44.9 
 
 
421 aa  92.8  1e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4322  mutator family transposase  44.9 
 
 
421 aa  92.8  1e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.70031  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1330  ISAfe2, transposase  41.84 
 
 
420 aa  90.9  5e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.423267  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1810  transposase mutator type  44.9 
 
 
424 aa  89  2e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.214084  hitchhiker  0.00000000849882 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1437  transposase mutator type  44.9 
 
 
424 aa  89  2e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1388  transposase mutator type  44.9 
 
 
424 aa  89  2e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1277  transposase mutator type  44.9 
 
 
424 aa  89  2e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1130  transposase mutator type  44.9 
 
 
424 aa  89  2e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00513551 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0981  transposase mutator type  44.9 
 
 
424 aa  89  2e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0882  transposase mutator type  44.9 
 
 
424 aa  89  2e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.031699  normal  0.346969 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0407  transposase mutator type  44.9 
 
 
424 aa  89  2e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.994637  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06390  transposase  40.82 
 
 
426 aa  79  0.00000000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00660  transposase  40.82 
 
 
426 aa  79  0.00000000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2066  transposase, mutator type  48.51 
 
 
439 aa  75.9  0.0000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0791542 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4741  transposase, mutator type  48.51 
 
 
439 aa  75.9  0.0000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.934265 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0604  transposase, mutator type  48.51 
 
 
439 aa  75.9  0.0000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.574476  normal 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5387  transposase, mutator type  43.88 
 
 
438 aa  73.6  0.0000000000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.294964  normal 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5830  transposase, mutator type  45.54 
 
 
439 aa  72  0.000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5459  transposase, mutator type  45.54 
 
 
439 aa  72  0.000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5450  transposase, mutator type  45.54 
 
 
439 aa  72  0.000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.790531  normal  0.0527916 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5856  transposase, mutator type  45.54 
 
 
439 aa  72  0.000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.128333  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0840  transposase, mutator type  45.54 
 
 
439 aa  72  0.000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0937  transposase, mutator type  45.54 
 
 
439 aa  72  0.000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.336688  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1475  transposase, mutator type  45.54 
 
 
439 aa  72  0.000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5433  transposase, mutator type  45.54 
 
 
439 aa  72  0.000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  normal  0.0965425 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5584  transposase, mutator type  43.88 
 
 
464 aa  71.6  0.000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.334824  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1439  transposase, mutator type  43.88 
 
 
434 aa  68.6  0.00000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.648976 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5521  transposase, mutator type  43.88 
 
 
469 aa  67.8  0.00000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  normal  0.380612 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5923  transposase, mutator type  43.88 
 
 
469 aa  67.8  0.00000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.383294  normal 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4028  hypothetical protein  51.61 
 
 
131 aa  65.5  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014159  Tpau_4276  transposase mutator type  43.88 
 
 
436 aa  63.5  0.0000000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014159  Tpau_4286  transposase mutator type  43.88 
 
 
436 aa  63.5  0.0000000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014159  Tpau_4304  transposase mutator type  43.88 
 
 
436 aa  63.5  0.0000000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.26589  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0294  transposase mutator type  43.88 
 
 
436 aa  63.5  0.0000000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0119  transposase mutator type  45.28 
 
 
386 aa  52.8  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1694  transposase mutator type  33.67 
 
 
421 aa  50.4  0.000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.000397883  normal 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3331  hypothetical protein  33.67 
 
 
420 aa  50.4  0.000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.354049  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3105  transposase mutator type  33.67 
 
 
420 aa  50.4  0.000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.295612  normal  0.0910349 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3061  transposase mutator type  33.67 
 
 
420 aa  50.4  0.000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.359832  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2572  transposase mutator type  33.67 
 
 
420 aa  50.4  0.000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0525687  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2302  transposase mutator type  33.67 
 
 
420 aa  50.4  0.000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.301831  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2013  transposase mutator type  33.67 
 
 
420 aa  50.4  0.000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1890  transposase mutator type  33.67 
 
 
420 aa  50.4  0.000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.475409 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1733  transposase mutator type  33.67 
 
 
420 aa  50.4  0.000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0304536  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1718  transposase mutator type  33.67 
 
 
420 aa  50.4  0.000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1469  transposase mutator type  33.67 
 
 
420 aa  50.4  0.000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000324779 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1303  transposase mutator type  33.67 
 
 
420 aa  50.4  0.000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.457317 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1261  transposase mutator type  33.67 
 
 
420 aa  50.4  0.000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.657807 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1250  transposase mutator type  33.67 
 
 
420 aa  50.4  0.000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.804004  normal  0.148761 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0873  transposase mutator type  33.67 
 
 
420 aa  50.4  0.000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.709604 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0010  transposase mutator type  33.67 
 
 
420 aa  50.4  0.000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.113874  normal  0.0774421 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1966  hypothetical protein  74.19 
 
 
86 aa  49.3  0.00002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>