44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene B21_04130 on replicon NC_012892
Organism: Escherichia coli BL21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001637  EcDH1_3697  photosystem I assembly BtpA  100 
 
 
268 aa  556  1e-157  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04130  hypothetical protein  100 
 
 
268 aa  556  1e-157  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04168  predicted nucleoside triphosphatase  100 
 
 
268 aa  556  1e-157  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1729  hypothetical protein  92.54 
 
 
268 aa  518  1e-146  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.149256  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1732  hypothetical protein  92.54 
 
 
268 aa  518  1e-146  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1793  hypothetical protein  92.91 
 
 
268 aa  519  1e-146  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.380259  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1727  hypothetical protein  92.16 
 
 
268 aa  515  1.0000000000000001e-145  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.19381  normal  0.3665 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1546  hypothetical protein  92.16 
 
 
268 aa  515  1.0000000000000001e-145  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3749  photosystem I assembly BtpA  70.79 
 
 
272 aa  401  1e-111  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2462  photosystem I assembly BtpA  59.77 
 
 
271 aa  330  1e-89  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2423  photosystem I assembly BtpA  59.77 
 
 
271 aa  330  1e-89  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3686  photosystem I assembly BtpA  60.3 
 
 
272 aa  330  1e-89  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2468  photosystem I assembly BtpA  59.77 
 
 
271 aa  330  1e-89  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.492629  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3780  photosystem I assembly BtpA  59.02 
 
 
273 aa  329  3e-89  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.579042  normal  0.711363 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2619  photosystem I assembly BtpA  59.77 
 
 
272 aa  327  1.0000000000000001e-88  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.509941  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3314  photosystem I assembly BtpA  55.26 
 
 
268 aa  310  2e-83  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1266  photosystem I assembly BtpA  48.82 
 
 
267 aa  223  4e-57  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2112  photosystem I assembly BtpA  47.19 
 
 
267 aa  220  1.9999999999999999e-56  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.348808  normal  0.986684 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3868  photosystem I assembly BtpA  32.44 
 
 
283 aa  123  3e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.732531  normal  0.216274 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4795  photosystem I assembly BtpA  27.97 
 
 
290 aa  122  8e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.89361 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3031  photosystem I assembly BtpA  28.57 
 
 
282 aa  120  3e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3089  photosystem I assembly BtpA  28.2 
 
 
282 aa  119  7.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2513  photosystem I assembly BtpA  28.41 
 
 
294 aa  115  7.999999999999999e-25  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.145919 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0640  photosystem I assembly BtpA  28.3 
 
 
309 aa  115  8.999999999999998e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.154831 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0541  photosystem I assembly BtpA  31.68 
 
 
283 aa  113  3e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.354682  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0235  photosystem I assembly BtpA  28.68 
 
 
284 aa  113  3e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.569155  normal  0.455637 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0469  photosystem I assembly BtpA  27.82 
 
 
283 aa  113  3e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2015  photosystem I assembly BtpA  31.8 
 
 
284 aa  112  8.000000000000001e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0445  photosystem I assembly BtpA  27.17 
 
 
282 aa  106  4e-22  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7481  hypothetical protein  28.46 
 
 
280 aa  105  8e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  decreased coverage  0.0069483  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6166  photosystem I assembly BtpA  28.03 
 
 
280 aa  102  5e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000474766 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1521  photosystem I assembly BtpA  29.26 
 
 
278 aa  93.2  4e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1136  photosystem I assembly BtpA  30.42 
 
 
258 aa  92.8  5e-18  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0171957  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3523  photosystem I assembly BtpA  31.4 
 
 
281 aa  92.8  5e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0910027  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1082  photosystem I assembly BtpA  27.17 
 
 
262 aa  87  3e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2153  photosystem I assembly BtpA  29.28 
 
 
265 aa  85.5  8e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.206239 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3693  BtpA protein  26.69 
 
 
280 aa  82  0.000000000000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3428  photosystem I assembly BtpA  26.54 
 
 
280 aa  75.1  0.000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2116  photosystem I assembly BtpA  30.11 
 
 
275 aa  74.7  0.000000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1474  photosystem I assembly BtpA  25.2 
 
 
279 aa  74.3  0.000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0929  photosystem I assembly BtpA  25.5 
 
 
241 aa  60.5  0.00000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.28389  normal  0.101264 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0889  photosystem I assembly BtpA  24.81 
 
 
242 aa  57.4  0.0000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1972  photosystem I assembly BtpA  26.17 
 
 
242 aa  44.3  0.002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1621  photosystem I assembly BtpA  25.31 
 
 
241 aa  43.5  0.003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.123371  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>