25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_46310 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012560  Avin_46310  hypothetical protein  100 
 
 
145 aa  298  2e-80  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.123911  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1372  hypothetical protein  40.13 
 
 
161 aa  115  1.9999999999999998e-25  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2092  hypothetical protein  41.04 
 
 
144 aa  109  1.0000000000000001e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0076  hypothetical protein  41.79 
 
 
168 aa  106  1e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2467  hypothetical protein  37.86 
 
 
146 aa  100  5e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2135  hypothetical protein  37.04 
 
 
151 aa  98.6  2e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0925  hypothetical protein  40.71 
 
 
118 aa  97.4  5e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4776  hypothetical protein  33.33 
 
 
145 aa  97.1  8e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00268249 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3607  hypothetical protein  38.64 
 
 
141 aa  88.2  4e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.9799  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3527  hypothetical protein  39.42 
 
 
145 aa  87.8  5e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0342  hypothetical protein  32.62 
 
 
146 aa  87.4  6e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.881647 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1403  hypothetical protein  37.78 
 
 
141 aa  87.4  7e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.628547  normal  0.692701 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13970  hypothetical protein  36.96 
 
 
211 aa  86.7  9e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.607556 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3765  hypothetical protein  35.51 
 
 
146 aa  81.3  0.000000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2280  hypothetical protein  35.77 
 
 
142 aa  80.9  0.000000000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2062  hypothetical protein  34.92 
 
 
146 aa  76.6  0.00000000000009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0457353  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3329  hypothetical protein  32.35 
 
 
142 aa  75.9  0.0000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0392  hypothetical protein  32.84 
 
 
149 aa  75.5  0.0000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.2643  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1294  hypothetical protein  29.71 
 
 
145 aa  71.2  0.000000000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0137379  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2149  hypothetical protein  28.89 
 
 
142 aa  69.3  0.00000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.167066  normal  0.288059 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3744  phosphoribosyltransferase-like protein  30.28 
 
 
418 aa  58.2  0.00000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.478029  normal  0.0623345 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3703  Protein of unknown function DUF2267  29.7 
 
 
138 aa  46.6  0.0001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0380  hypothetical protein  28.04 
 
 
141 aa  45.8  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0149  hypothetical protein  25.93 
 
 
139 aa  43.1  0.001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2011  CBS domain-containing protein  28.95 
 
 
286 aa  41.6  0.004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>