47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_45120 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012560  Avin_45120  hypothetical protein  100 
 
 
108 aa  205  2e-52  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.153963  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0498  hypothetical protein  34.57 
 
 
123 aa  52.4  0.000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0386  hypothetical protein  34.57 
 
 
123 aa  50.8  0.000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0372  hypothetical protein  34.57 
 
 
123 aa  50.8  0.000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0363  hypothetical protein  34.57 
 
 
123 aa  50.8  0.000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0360  hypothetical protein  34.57 
 
 
123 aa  50.8  0.000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0429  hypothetical protein  34.57 
 
 
123 aa  50.8  0.000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2022  hypothetical protein  33.73 
 
 
124 aa  49.7  0.00001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000128299  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0367  hypothetical protein  34.57 
 
 
123 aa  49.3  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0176  hypothetical protein  45.16 
 
 
124 aa  48.5  0.00003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0374  hypothetical protein  30.49 
 
 
123 aa  47  0.00008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2335  hypothetical protein  38.1 
 
 
133 aa  45.8  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.688143 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4873  hypothetical protein  36.23 
 
 
123 aa  45.1  0.0003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0357  hypothetical protein  38.27 
 
 
129 aa  45.1  0.0003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0451  hypothetical protein  34.78 
 
 
123 aa  44.3  0.0005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0758288  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0499  hypothetical protein  34.78 
 
 
123 aa  44.7  0.0005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1157  hypothetical protein  37.5 
 
 
132 aa  44.7  0.0005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1391  DnaJ-like, subfamily C, member 28  36.62 
 
 
132 aa  43.9  0.0008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0545891  normal  0.728464 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3296  hypothetical protein  40 
 
 
133 aa  43.1  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.555154  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2061  hypothetical protein  37.14 
 
 
141 aa  43.5  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2539  hypothetical protein  40 
 
 
168 aa  43.1  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.283089  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1515  hypothetical protein  40 
 
 
133 aa  43.1  0.001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3794  hypothetical protein  33.82 
 
 
107 aa  43.1  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2014  hypothetical protein  40 
 
 
133 aa  43.1  0.001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1286  hypothetical protein  40 
 
 
133 aa  43.1  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.294721  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2438  hypothetical protein  40 
 
 
133 aa  43.1  0.001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0195653  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2395  hypothetical protein  40 
 
 
133 aa  43.1  0.001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1425  hypothetical protein  36.92 
 
 
127 aa  42.7  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1919  hypothetical protein  37.14 
 
 
133 aa  42.4  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0889202  normal  0.242768 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0019  hypothetical protein  38.33 
 
 
126 aa  42.7  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0621  hypothetical protein  35.94 
 
 
123 aa  42.7  0.002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0033  hypothetical protein  35.38 
 
 
126 aa  42  0.003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03095  hypothetical protein  39.44 
 
 
122 aa  41.2  0.005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0420  conserved hypothetical protein  39.44 
 
 
122 aa  41.2  0.005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.698705  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4615  hypothetical protein  39.44 
 
 
122 aa  41.2  0.005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00242276  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03144  hypothetical protein  39.44 
 
 
122 aa  41.2  0.005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3679  hypothetical protein  39.44 
 
 
122 aa  41.2  0.005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1306  hypothetical protein  37.14 
 
 
133 aa  41.2  0.005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.815416  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0420  hypothetical protein  39.44 
 
 
122 aa  41.2  0.005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0418583  hitchhiker  0.00000243699 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3776  hypothetical protein  39.44 
 
 
122 aa  41.2  0.005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0228231  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3487  hypothetical protein  39.44 
 
 
122 aa  41.2  0.005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0132445  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1301  hypothetical protein  35.24 
 
 
133 aa  40.8  0.006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0801556 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2030  hypothetical protein  25.51 
 
 
104 aa  40.8  0.006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000204387  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1416  hypothetical protein  33.33 
 
 
189 aa  40.8  0.007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.156196  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1884  hypothetical protein  35.24 
 
 
133 aa  40.4  0.008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.377448  normal  0.627618 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1957  hypothetical protein  35.24 
 
 
133 aa  40.4  0.008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1988  hypothetical protein  33.64 
 
 
114 aa  40  0.01  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.480942  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>