13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_36370 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012560  Avin_36370  hypothetical protein  100 
 
 
118 aa  224  2e-58  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.375458  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4522  hypothetical protein  41.1 
 
 
115 aa  57.4  0.00000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.564458  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60010  hypothetical protein  39.73 
 
 
113 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00176506  hitchhiker  0.00000000540144 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3430  hypothetical protein  39.18 
 
 
119 aa  52.4  0.000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.692072  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1427  hypothetical protein  32.18 
 
 
124 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.273174  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0689  hypothetical protein  33.65 
 
 
117 aa  47.4  0.00007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.293413  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0847  hypothetical protein  33.8 
 
 
122 aa  45.1  0.0004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2865  hypothetical protein  35.11 
 
 
114 aa  44.3  0.0006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4185  hypothetical protein  40.91 
 
 
123 aa  44.3  0.0007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.295357  normal  0.923646 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2359  hypothetical protein  40.86 
 
 
118 aa  42.7  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000000686199  unclonable  0.000000113838 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1250  hypothetical protein  40.58 
 
 
119 aa  43.5  0.001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.64144  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1178  hypothetical protein  39.13 
 
 
119 aa  41.6  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2400  hypothetical protein  39.58 
 
 
117 aa  40.8  0.007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>