48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_22840 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012560  Avin_22840  SdiA-regulated domain-containing protein  100 
 
 		 308 aa  612  9.999999999999999e-175  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0239521  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4227  SdiA-regulated domain-containing protein  63.73 
 
 		 303 aa  366  1e-100  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5204  SdiA-regulated domain-containing protein  62.93 
 
 		 300 aa  361  9e-99  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5151  SdiA-regulated domain protein  63.83 
 
 		 300 aa  361  1e-98  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.965879  normal  0.786945 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5058  SdiA-regulated domain-containing protein  63.83 
 
 		 300 aa  360  1e-98  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0993064  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04270  putative transcriptional regulator  64.75 
 
 		 321 aa  358  6e-98  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.510674  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0418  hypothetical protein  64.39 
 
 		 321 aa  358  9e-98  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0314  SdiA-regulated domain-containing protein  62.01 
 
 		 303 aa  353  2e-96  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.183725 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5383  SdiA-regulated  58.42 
 
 		 305 aa  339  2.9999999999999998e-92  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.02449 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4848  SdiA-regulated  56.07 
 
 		 317 aa  309  2.9999999999999997e-83  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5290  hypothetical protein  55.36 
 
 		 312 aa  305  9.000000000000001e-82  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.842454  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38420  hypothetical protein  51.79 
 
 		 309 aa  266  5e-70  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.224716 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3272  SdiA-regulated protein  52.35 
 
 		 325 aa  259  5.0000000000000005e-68  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4229  SdiA-regulated domain-containing protein  47.43 
 
 		 317 aa  224  1e-57  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48290  hypothetical protein  45.88 
 
 		 305 aa  218  7.999999999999999e-56  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5205  SdiA-regulated domain-containing protein  40.52 
 
 		 305 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.520929  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04160  putatitve transcriptional regulator  40.34 
 
 		 329 aa  212  7.999999999999999e-54  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5059  SdiA-regulated domain-containing protein  40.2 
 
 		 306 aa  208  1e-52  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.181452  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0412  putatitve transcriptional regulator  41.91 
 
 		 310 aa  207  2e-52  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.470848  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0313  SdiA-regulated domain-containing protein  39.02 
 
 		 306 aa  203  3e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.124016 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5152  SdiA-regulated domain protein  39.53 
 
 		 306 aa  201  9.999999999999999e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.767361 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4849  SdiA-regulated  38.36 
 
 		 314 aa  196  3e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5291  hypothetical protein  39.25 
 
 		 310 aa  195  7e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07110  hypothetical protein  46.06 
 
 		 317 aa  189  5.999999999999999e-47  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.187526  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5110  SdiA-regulated  38.24 
 
 		 326 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5384  SdiA-regulated  38.58 
 
 		 307 aa  179  4e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0252012 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5589  hypothetical protein  37.11 
 
 		 326 aa  179  4.999999999999999e-44  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4878  SdiA-regulated protein  34.13 
 
 		 329 aa  167  2e-40  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.60346 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5845  SdiA-regulated protein  33.86 
 
 		 280 aa  162  9e-39  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.539509 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4706  SdiA-regulated family protein  36.4 
 
 		 286 aa  157  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4573  sdiA-regulated family protein  36.4 
 
 		 286 aa  157  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4566  hypothetical protein  36.4 
 
 		 301 aa  157  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.859711  normal  0.266567 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4658  hypothetical protein  36.4 
 
 		 301 aa  157  3e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4933  hypothetical protein  33.47 
 
 		 323 aa  155  6e-37  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4561  hypothetical protein  31.14 
 
 		 323 aa  155  6e-37  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4657  hypothetical protein  36.03 
 
 		 301 aa  155  8e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04202  hypothetical protein  31.49 
 
 		 322 aa  155  1e-36  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00228683  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04165  hypothetical protein  31.49 
 
 		 322 aa  155  1e-36  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00151161  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4772  conserved hypothetical protein yjiK  31.27 
 
 		 323 aa  154  1e-36  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3731  SdiA-regulated domain-containing protein  31.14 
 
 		 286 aa  154  1e-36  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00663861  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3663  SdiA-regulated domain protein  31.49 
 
 		 323 aa  154  2e-36  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000154748  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4588  SrgB  38.58 
 
 		 282 aa  133  3.9999999999999996e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.537966  normal  0.854638 
 
 
-
 
NC_011204  SeD_B0044  SrgB  38.58 
 
 		 282 aa  133  3.9999999999999996e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.880775 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4679  hypothetical protein  37.01 
 
 		 282 aa  129  7.000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2428  hypothetical protein  33.88 
 
 		 302 aa  105  9e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0451472  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5082  sdiA-regulated domain protein  29.11 
 
 		 272 aa  98.6  1e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.142061 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1215  inner membrane protein  23.2 
 
 		 280 aa  53.5  0.000004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1385  putative extracellular nuclease  23.89 
 
 		 751 aa  52.8  0.000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.14292  normal  0.827149 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>