49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_07110 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012560  Avin_07110  hypothetical protein  100 
 
 		 317 aa  633    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.187526  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0418  hypothetical protein  41.99 
 
 		 321 aa  202  7e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04270  putative transcriptional regulator  42.39 
 
 		 321 aa  202  7e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.510674  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5110  SdiA-regulated  38.05 
 
 		 326 aa  199  6e-50  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5589  hypothetical protein  39.58 
 
 		 326 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22840  SdiA-regulated domain-containing protein  43.48 
 
 		 308 aa  189  7e-47  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0239521  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0314  SdiA-regulated domain-containing protein  42.81 
 
 		 303 aa  189  7e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.183725 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5204  SdiA-regulated domain-containing protein  41.69 
 
 		 300 aa  188  9e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5058  SdiA-regulated domain-containing protein  42.31 
 
 		 300 aa  187  2e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0993064  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5383  SdiA-regulated  38.49 
 
 		 305 aa  187  2e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.02449 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5151  SdiA-regulated domain protein  42.31 
 
 		 300 aa  187  3e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.965879  normal  0.786945 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4227  SdiA-regulated domain-containing protein  37.86 
 
 		 303 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4848  SdiA-regulated  37.24 
 
 		 317 aa  179  4.999999999999999e-44  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5290  hypothetical protein  36.77 
 
 		 312 aa  176  4e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.842454  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38420  hypothetical protein  39.08 
 
 		 309 aa  176  5e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.224716 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3272  SdiA-regulated protein  37.68 
 
 		 325 aa  165  9e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4573  sdiA-regulated family protein  35.02 
 
 		 286 aa  154  2e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4658  hypothetical protein  35.02 
 
 		 301 aa  154  2e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4706  SdiA-regulated family protein  35.02 
 
 		 286 aa  154  2e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4566  hypothetical protein  35.02 
 
 		 301 aa  153  5e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.859711  normal  0.266567 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4657  hypothetical protein  34.63 
 
 		 301 aa  152  7e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4229  SdiA-regulated domain-containing protein  33.33 
 
 		 317 aa  152  8.999999999999999e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5291  hypothetical protein  34.58 
 
 		 310 aa  151  2e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4849  SdiA-regulated  34.06 
 
 		 314 aa  150  3e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0313  SdiA-regulated domain-containing protein  34.16 
 
 		 306 aa  142  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.124016 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5059  SdiA-regulated domain-containing protein  34.16 
 
 		 306 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.181452  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5152  SdiA-regulated domain protein  34.75 
 
 		 306 aa  140  3e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.767361 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5205  SdiA-regulated domain-containing protein  34.16 
 
 		 305 aa  140  3e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.520929  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4933  hypothetical protein  28.57 
 
 		 323 aa  139  3.9999999999999997e-32  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04202  hypothetical protein  28.94 
 
 		 322 aa  139  6e-32  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00228683  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04165  hypothetical protein  28.94 
 
 		 322 aa  139  6e-32  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00151161  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3663  SdiA-regulated domain protein  28.94 
 
 		 323 aa  139  6e-32  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000154748  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3731  SdiA-regulated domain-containing protein  28.94 
 
 		 286 aa  139  7e-32  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00663861  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4561  hypothetical protein  29.04 
 
 		 323 aa  137  2e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4772  conserved hypothetical protein yjiK  28.57 
 
 		 323 aa  134  9.999999999999999e-31  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5384  SdiA-regulated  32.27 
 
 		 307 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0252012 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48290  hypothetical protein  36.43 
 
 		 305 aa  133  3.9999999999999996e-30  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04160  putatitve transcriptional regulator  31.56 
 
 		 329 aa  132  9e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0412  putatitve transcriptional regulator  32.11 
 
 		 310 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.470848  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5845  SdiA-regulated protein  28.1 
 
 		 280 aa  129  4.0000000000000003e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.539509 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4878  SdiA-regulated protein  29.3 
 
 		 329 aa  128  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.60346 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4588  SrgB  33.47 
 
 		 282 aa  112  9e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.537966  normal  0.854638 
 
 
-
 
NC_011204  SeD_B0044  SrgB  33.47 
 
 		 282 aa  112  9e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.880775 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4679  hypothetical protein  33.06 
 
 		 282 aa  110  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2428  hypothetical protein  29.06 
 
 		 302 aa  84.7  0.000000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0451472  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5082  sdiA-regulated domain protein  26.03 
 
 		 272 aa  80.5  0.00000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.142061 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1269  inner membrane protein  30.92 
 
 		 268 aa  63.2  0.000000006  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1215  inner membrane protein  24.1 
 
 		 280 aa  57  0.0000004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1385  putative extracellular nuclease  30.71 
 
 		 751 aa  53.9  0.000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.14292  normal  0.827149 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>