38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_04610 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012560  Avin_04610  hypothetical protein  100 
 
 
84 aa  168  2e-41  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4254  hypothetical protein  77.38 
 
 
84 aa  136  8.999999999999999e-32  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000233068 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5877  hypothetical protein  72.29 
 
 
86 aa  127  7.000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67900  hypothetical protein  71.08 
 
 
86 aa  124  6e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0525665  normal  0.0342115 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4917  hypothetical protein  70.93 
 
 
86 aa  121  3e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.969012  hitchhiker  0.00139076 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0311  hypothetical protein  70.59 
 
 
86 aa  119  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.399436  decreased coverage  0.00561451 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0291  hypothetical protein  70.59 
 
 
86 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0001659 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5336  hypothetical protein  71.25 
 
 
86 aa  118  3e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0316  hypothetical protein  70.59 
 
 
86 aa  117  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0325  hypothetical protein  65.48 
 
 
86 aa  117  7e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.629944 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4895  hypothetical protein  70 
 
 
92 aa  115  9.999999999999999e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02128  hypothetical protein  33.33 
 
 
80 aa  51.6  0.000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.555122  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05926  hypothetical protein  30.26 
 
 
80 aa  50.4  0.000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2851  hypothetical protein  30.67 
 
 
87 aa  49.7  0.00001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1923  hypothetical protein  31.75 
 
 
91 aa  45.4  0.0003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2302  hypothetical protein  29.49 
 
 
82 aa  44.7  0.0005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1938  hypothetical protein  26.25 
 
 
82 aa  43.9  0.0007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2568  hypothetical protein  33.8 
 
 
84 aa  43.1  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2829  hypothetical protein  33.8 
 
 
81 aa  43.1  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.493287  normal  0.100972 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000196  hypothetical protein  24 
 
 
80 aa  43.1  0.001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000000484737  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2420  hypothetical protein  32.86 
 
 
88 aa  42.4  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0761064  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1564  hypothetical protein  30.99 
 
 
103 aa  42  0.003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3173  hypothetical protein  42.86 
 
 
79 aa  42  0.003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3339  hypothetical protein  29.76 
 
 
82 aa  41.6  0.004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4266  hypothetical protein  24.69 
 
 
85 aa  41.2  0.005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0504269  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3669  hypothetical protein  30.95 
 
 
83 aa  40.8  0.006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0208069  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3647  hypothetical protein  30.95 
 
 
83 aa  40.8  0.006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3645  hypothetical protein  32.2 
 
 
90 aa  41.2  0.006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1987  hypothetical protein  30.99 
 
 
103 aa  40.8  0.007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3039  hypothetical protein  30.99 
 
 
103 aa  40.8  0.007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2987  hypothetical protein  30.99 
 
 
103 aa  40.8  0.007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2625  hypothetical protein  30.99 
 
 
103 aa  40.8  0.007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.65052  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0793  hypothetical protein  30.99 
 
 
103 aa  40.8  0.007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3697  hypothetical protein  30.95 
 
 
82 aa  40.8  0.007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.514391  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3388  hypothetical protein  30.95 
 
 
82 aa  40.8  0.007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.032209  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3427  hypothetical protein  30.95 
 
 
82 aa  40.8  0.007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3073  hypothetical protein  30.99 
 
 
88 aa  40.4  0.008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0320515  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2119  hypothetical protein  30.99 
 
 
88 aa  40.4  0.008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0325664  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>