20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_9867 on replicon NC_011986
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011986  Avi_9867  hypothetical protein  100 
 
 		 134 aa  272  1.0000000000000001e-72  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4219  hypothetical protein  58.73 
 
 		 135 aa  146  9e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.860322  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3974  hypothetical protein  59.48 
 
 		 135 aa  145  2.0000000000000003e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.890346  normal  0.211994 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3129  hypothetical protein  59.82 
 
 		 135 aa  142  2e-33  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.467017  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4593  hypothetical protein  61.11 
 
 		 135 aa  140  5e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.434724  normal  0.934073 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4831  hypothetical protein  61.11 
 
 		 135 aa  139  9e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.790573  normal  0.0686634 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0059  hypothetical protein  55.86 
 
 		 130 aa  125  1.0000000000000001e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1021  hypothetical protein  50 
 
 		 182 aa  120  8e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3811  hypothetical protein  53.77 
 
 		 134 aa  119  9.999999999999999e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.310353  normal  0.250306 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4110  hypothetical protein  55.05 
 
 		 131 aa  119  9.999999999999999e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3641  hypothetical protein  54.9 
 
 		 130 aa  118  3e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.60929  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1852  hypothetical protein  46.77 
 
 		 136 aa  117  7e-26  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3428  hypothetical protein  55.88 
 
 		 130 aa  115  1.9999999999999998e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4357  hypothetical protein  42.86 
 
 		 135 aa  115  1.9999999999999998e-25  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.513388  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1605  putative exported protein of unknown function  55.14 
 
 		 131 aa  115  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.856791  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2739  hypothetical protein  55.34 
 
 		 131 aa  112  1.0000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.287919  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2565  hypothetical protein  48.41 
 
 		 182 aa  113  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.339872 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4659  hypothetical protein  43.61 
 
 		 135 aa  105  2e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.185884 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1101  hypothetical protein  45.22 
 
 		 134 aa  103  7e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.578785 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0354  RND family efflux transporter MFP subunit  42.48 
 
 		 518 aa  79  0.00000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.564378  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>