35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_7100 on replicon NC_011981
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011981  Avi_7100  hypothetical protein  100 
 
 
189 aa  396  1e-109  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09461  L-asparaginase II  33.68 
 
 
320 aa  58.5  0.00000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0821192  hitchhiker  0.0000193359 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08961  L-asparaginase II  32.94 
 
 
304 aa  58.5  0.00000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0166  hypothetical protein  29.52 
 
 
317 aa  57  0.0000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1785  L-asparaginase II  28 
 
 
317 aa  54.7  0.0000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_10491  L-asparaginase II  33.78 
 
 
321 aa  54.7  0.0000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.740368  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2866  L-asparaginase II  33.33 
 
 
332 aa  54.3  0.000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.687788  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2513  L-asparaginase II  27.84 
 
 
317 aa  52.4  0.000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.852164  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0435  L-asparaginase II  35 
 
 
320 aa  52.4  0.000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.235229  normal  0.953349 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4641  asparaginase  30.49 
 
 
316 aa  51.6  0.000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.599926  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0733  L-asparaginase II  31.33 
 
 
317 aa  51.6  0.000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000465625  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_13811  L-asparaginase II  31.91 
 
 
325 aa  50.8  0.00001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.126115 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0840  hypothetical protein  30.36 
 
 
325 aa  50.4  0.00001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3000  L-asparaginase II  26.02 
 
 
317 aa  48.9  0.00004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.169093  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4556  L-asparaginase II  27.78 
 
 
315 aa  48.9  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.305976  normal  0.918763 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3120  L-asparaginase II  26.02 
 
 
317 aa  48.9  0.00004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0851  L-asparaginase II  26.96 
 
 
335 aa  48.5  0.00006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1163  hypothetical protein  28.71 
 
 
335 aa  48.1  0.00008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0471275  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0222  L-asparaginase II  30.38 
 
 
320 aa  47.8  0.0001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0254392  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_08881  L-asparaginase II  30.38 
 
 
320 aa  47  0.0002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.415864  hitchhiker  0.0000135273 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0899  L-asparaginase II  31.82 
 
 
335 aa  47  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.499511 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1815  hypothetical protein  30 
 
 
322 aa  46.6  0.0002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.735411  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0979  L-asparaginase II  29.63 
 
 
321 aa  46.2  0.0003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.225004  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0784  L-asparaginase II  29.41 
 
 
335 aa  45.4  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.109561 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01750  asparaginase  30.48 
 
 
334 aa  44.7  0.0007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0570  L-asparaginase II  29.46 
 
 
336 aa  44.7  0.0008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.878025  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1336  L-asparaginase II  25.56 
 
 
336 aa  44.3  0.001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.156479  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3410  L-asparaginase II  36.17 
 
 
324 aa  43.5  0.002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2069  L-asparaginase II  29.57 
 
 
331 aa  43.5  0.002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0311  L-asparaginase II  27 
 
 
334 aa  42.7  0.003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_10491  L-asparaginase II  32.22 
 
 
321 aa  42.4  0.004  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0556  hypothetical protein  26.58 
 
 
340 aa  42  0.005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0555  hypothetical protein  26.58 
 
 
340 aa  42  0.005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.943367  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3025  putative L-asparaginase II  29.41 
 
 
362 aa  42  0.006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0267794 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3455  L-asparaginase II  27.17 
 
 
354 aa  41.2  0.009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.282624 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>