19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_5784 on replicon NC_011988
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011988  Avi_5784  hypothetical protein  100 
 
 		 468 aa  939    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2679  hypothetical protein  32.98 
 
 		 503 aa  210  5e-53  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.495169  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0311  hypothetical protein  32.64 
 
 		 513 aa  204  3e-51  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.353136 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0355  hypothetical protein  31.73 
 
 		 513 aa  200  3.9999999999999996e-50  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.335502  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0387  hypothetical protein  32.56 
 
 		 512 aa  192  1e-47  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0989  hypothetical protein  28.9 
 
 		 480 aa  159  7e-38  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  decreased coverage  0.00407781  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4191  hypothetical protein  27.66 
 
 		 478 aa  139  8.999999999999999e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.554467  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1856  hypothetical protein  27.48 
 
 		 479 aa  139  1e-31  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1786  hypothetical protein  27.48 
 
 		 479 aa  138  2e-31  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.766735  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0644  hypothetical protein  27.35 
 
 		 479 aa  133  7.999999999999999e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.426994  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3092  hypothetical protein  26.86 
 
 		 512 aa  121  1.9999999999999998e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3739  hypothetical protein  26.65 
 
 		 505 aa  120  4.9999999999999996e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2146  hypothetical protein  28.76 
 
 		 459 aa  116  1.0000000000000001e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.107944  normal  0.048736 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3863  hypothetical protein  35.43 
 
 		 476 aa  113  6e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00584301  normal  0.146165 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0142  hypothetical protein  24.18 
 
 		 474 aa  94.4  4e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.000223018  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2038  hypothetical protein  36.36 
 
 		 466 aa  66.6  0.0000000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.561134  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2407  hypothetical protein  36.36 
 
 		 431 aa  66.6  0.0000000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1436  hypothetical protein  31.82 
 
 		 448 aa  57.4  0.0000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1010  hypothetical protein  29.09 
 
 		 120 aa  50.1  0.00009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000066035  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>