29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_4040 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_4040  hypothetical protein  100 
 
 		 263 aa  532  1e-150  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3585  hypothetical protein  55.17 
 
 		 258 aa  267  1e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0908002 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3878  hypothetical protein  53.22 
 
 		 260 aa  259  3e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0512827 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2555  putative signal peptide protein  44.84 
 
 		 258 aa  244  9.999999999999999e-64  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.709242  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR2016  hypothetical protein  37.4 
 
 		 271 aa  182  3e-45  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.915492  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1940  hypothetical protein  37.4 
 
 		 271 aa  182  5.0000000000000004e-45  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0919  hypothetical protein  38.43 
 
 		 276 aa  178  9e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.40379  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3078  hypothetical protein  34.62 
 
 		 255 aa  149  6e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.186835  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0493  hypothetical protein  32.62 
 
 		 290 aa  118  9.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.500337  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0282  hypothetical protein  30.04 
 
 		 293 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.108801 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0547  hypothetical protein  29.61 
 
 		 296 aa  109  4.0000000000000004e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0653377 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0544  hypothetical protein  29.18 
 
 		 333 aa  105  9e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.520266 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7547  hypothetical protein  29.49 
 
 		 258 aa  102  5e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4587  hypothetical protein  30 
 
 		 280 aa  99  6e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0428092  normal  0.0490486 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0172  hypothetical protein  28.99 
 
 		 275 aa  99  8e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0152845  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4517  hypothetical protein  26.18 
 
 		 287 aa  95.5  7e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0243839  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1938  hypothetical protein  26.91 
 
 		 287 aa  94.7  1e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.208921  normal  0.0147778 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0503  hypothetical protein  28.46 
 
 		 286 aa  92.4  6e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3702  hypothetical protein  26.18 
 
 		 311 aa  92.4  7e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.317768 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4907  hypothetical protein  27.72 
 
 		 298 aa  91.3  1e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.904735  normal  0.713064 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1857  hypothetical protein  26.89 
 
 		 273 aa  91.7  1e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.746248 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4859  hypothetical protein  27.49 
 
 		 298 aa  91.3  1e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.332433 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4396  hypothetical protein  27.49 
 
 		 306 aa  91.3  2e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.558315  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3666  hypothetical protein  25.32 
 
 		 287 aa  90.5  3e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000879372 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0407  hypothetical protein  27.04 
 
 		 289 aa  89.4  6e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.467688 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3592  hypothetical protein  26.67 
 
 		 288 aa  84.3  0.000000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.456108  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1704  hypothetical protein  30.57 
 
 		 297 aa  84  0.000000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.624159  normal  0.112956 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2639  hypothetical protein  26.52 
 
 		 292 aa  64.7  0.000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2291  hypothetical protein  24.35 
 
 		 259 aa  62.8  0.000000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.429146  normal  0.89015 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>