20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_2596 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_2596  dolichyl-phosphate mannose synthase  100 
 
 		 231 aa  476  1e-133  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.406323  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2465  hypothetical protein  37.72 
 
 		 232 aa  152  2.9999999999999998e-36  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0349  nucleotidyl transferase  31.11 
 
 		 240 aa  87.8  1e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.309599  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2464  nucleotidyl transferase  28.44 
 
 		 504 aa  80.5  0.00000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0305  capsular polysaccharide biosynthesis protein, putative nucleotidyltransferase  26.99 
 
 		 246 aa  79.3  0.00000000000005  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.297803  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0347  nucleotidyl transferase  26.32 
 
 		 245 aa  72  0.000000000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0798326  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1803  dTDP-glucose pyrophosphorylase  26.22 
 
 		 241 aa  69.7  0.00000000003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2595  UTP-glucose-1-phosphate uridylyltransferase  25.89 
 
 		 494 aa  69.7  0.00000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.334164  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1806  putative nucleotidyltransferase  25.55 
 
 		 241 aa  69.3  0.00000000005  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.716393  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0612  nucleotidyl transferase  28.57 
 
 		 253 aa  67  0.0000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.639702 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0308  capsular polysaccharide biosynthesis protein, putative nucleotidyltransferase  25.75 
 
 		 245 aa  65.9  0.0000000005  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.684825  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0706  lipopolysaccharide biosynthesis protein, putative  28.05 
 
 		 253 aa  63.9  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0106  hypothetical protein  29.6 
 
 		 240 aa  60.1  0.00000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00105806 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0615  hypothetical protein  29.44 
 
 		 240 aa  58.5  0.00000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.651829 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0709  hypothetical protein  28.57 
 
 		 240 aa  51.2  0.00001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1663  hypothetical protein  25.45 
 
 		 246 aa  50.4  0.00002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0423  hypothetical protein  27.65 
 
 		 254 aa  49.3  0.00005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0302  capsular polysaccharide biosynthesis protein  22.27 
 
 		 243 aa  48.1  0.0001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.04779  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0732  hypothetical protein  25.54 
 
 		 251 aa  42.7  0.005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3892  hypothetical protein  22.52 
 
 		 242 aa  42  0.009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>