16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_B0329 on replicon NC_007410
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007410  Ava_B0329  hypothetical protein  100 
 
 
130 aa  271  2.0000000000000002e-72  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00304499  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3592  hypothetical protein  38.35 
 
 
146 aa  90.1  9e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3107  hypothetical protein  36.43 
 
 
157 aa  89.4  2e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000543353  decreased coverage  0.0000114562 
 
 
-
 
NC_009829  Spro_4940  hypothetical protein  35.83 
 
 
173 aa  82.4  0.000000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000000844553  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1551  hypothetical protein  38.46 
 
 
130 aa  81.6  0.000000000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.646726  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3389  hypothetical protein  39.37 
 
 
165 aa  69.7  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.248941  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6261  hypothetical protein  39.05 
 
 
160 aa  65.9  0.0000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0418  hypothetical protein  32.26 
 
 
202 aa  64.7  0.0000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1518  hypothetical protein  32.33 
 
 
151 aa  63.5  0.0000000009  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00559169 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3177  hypothetical protein  31.3 
 
 
146 aa  60.5  0.000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1753  hypothetical protein  31.34 
 
 
149 aa  57.8  0.00000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.522125  n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4928  hypothetical protein  29.61 
 
 
155 aa  52  0.000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.936975  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3920  hypothetical protein  26.06 
 
 
137 aa  50.1  0.000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.879955  normal  0.416027 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3865  hypothetical protein  28.15 
 
 
236 aa  49.3  0.00002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0127474 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3017  hypothetical protein  30.83 
 
 
136 aa  47.4  0.00006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.196092  normal  0.052376 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1281  hypothetical protein  26.56 
 
 
131 aa  44.3  0.0005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000028564  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>