12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_3832 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007413  Ava_3832  succinoglycan biosynthesis ketolase  100 
 
 
304 aa  632  1e-180  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4913  ExoV-like protein  37.86 
 
 
285 aa  200  3e-50  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2966  ExoV-like protein  38.78 
 
 
296 aa  191  1e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0575869  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3215  ExoV-like protein  33.88 
 
 
300 aa  172  5e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.717423  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5933  succinoglycan biosynthesis protein  33.23 
 
 
321 aa  167  2e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4949  ExoV-like protein  31.87 
 
 
316 aa  167  2.9999999999999998e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.831937  normal  0.31532 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0650  ketal pyruvate transferase protein  33.55 
 
 
299 aa  141  9.999999999999999e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4804  ExoV-like protein  35.17 
 
 
333 aa  134  1.9999999999999998e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2755  exoV domain-containing protein  25.64 
 
 
271 aa  57.4  0.0000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26470  ExoV-like protein  27.96 
 
 
268 aa  55.1  0.000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4932  hypothetical protein  24.66 
 
 
625 aa  44.3  0.002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07265  xanthan biosynthesis pyruvyltransferase GumL  27.59 
 
 
277 aa  42.4  0.009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.171579  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>