24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_1237 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014248  Aazo_5114  folate/biopterin transporter  74.76 
 
 
454 aa  656    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0603297  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0448  folate/biopterin transporter  70.59 
 
 
483 aa  634    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1237  biopterin transport-related protein BT1  100 
 
 
472 aa  935    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.122493  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3211  folate/biopterin transporter  69.69 
 
 
458 aa  601  1e-170  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.617016 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4223  folate/biopterin transporter  71.08 
 
 
468 aa  596  1e-169  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0325732 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4368  folate/biopterin transporter  69.21 
 
 
441 aa  590  1e-167  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00334747 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4307  folate/biopterin transporter  69.44 
 
 
441 aa  589  1e-167  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0197  folate/biopterin transporter  65.36 
 
 
453 aa  533  1e-150  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_21970  predicted protein  48.65 
 
 
495 aa  414  1e-114  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00490278  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_12682  FBT family transporter: folate/pteridine  48.04 
 
 
429 aa  385  1e-106  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.415206  normal  0.304325 
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_49534  predicted protein  27.73 
 
 
610 aa  146  6e-34  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_47802  predicted protein  23.82 
 
 
600 aa  125  2e-27  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1767  biopterin transporter  24 
 
 
428 aa  79.7  0.0000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_35682  FBT family transporter: folate/pteridine  31.85 
 
 
292 aa  75.9  0.000000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5066  MFS family transporter  22.44 
 
 
434 aa  72.8  0.00000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.714396  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1506  hypothetical protein  34.25 
 
 
564 aa  68.2  0.0000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0478439  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_32854  FBT family transporter: folate/pteridine  27.22 
 
 
547 aa  66.2  0.000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0956  hypothetical protein  26.9 
 
 
560 aa  66.2  0.000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03756  hypothetical protein  23.4 
 
 
435 aa  65.1  0.000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1267  major facilitator superfamily permease  28.08 
 
 
541 aa  64.3  0.000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.633668  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0680  major facilitator transporter  27.72 
 
 
414 aa  51.6  0.00003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.440664  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5297  RhtX/FptX family siderophore transporter  27.72 
 
 
415 aa  48.9  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0680678 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4990  major facilitator transporter  27.72 
 
 
415 aa  48.9  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.407927  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3377  major facilitator transporter  27.72 
 
 
415 aa  48.9  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>