14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_3368 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008541  Arth_3368  TadE family protein  100 
 
 
151 aa  286  6e-77  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3157  TadE family protein  59.14 
 
 
106 aa  104  4e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.254222 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18160  hypothetical protein  44.79 
 
 
147 aa  61.2  0.000000005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26070  hypothetical protein  37.7 
 
 
131 aa  52  0.000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.338413  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4299  TadE-like  41.24 
 
 
295 aa  49.7  0.00001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.288116  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33320  hypothetical protein  45.83 
 
 
159 aa  48.5  0.00003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.674032  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2221  TadE family protein  35.8 
 
 
157 aa  47.4  0.00006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.215241  normal  0.324888 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0124  hypothetical protein  39.37 
 
 
147 aa  43.5  0.001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00673106  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0048  hypothetical protein  45.83 
 
 
130 aa  43.1  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.653872  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0367  hypothetical protein  40.22 
 
 
125 aa  42.4  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.000168151  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1856  TadE family protein  46.67 
 
 
138 aa  42.4  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0164908  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2772  hypothetical protein  42.86 
 
 
131 aa  42.4  0.002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0125125  hitchhiker  0.0000106895 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25260  TadE-like protein  31.82 
 
 
132 aa  42  0.003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4833  hypothetical protein  37.14 
 
 
105 aa  41.2  0.005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>