25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_1439 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008541  Arth_1439  thiamineS protein  100 
 
 
88 aa  167  5e-41  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0227652  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1443  thiamineS protein  78.41 
 
 
88 aa  119  1.9999999999999998e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000277571 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0470  thiamineS protein  47.73 
 
 
87 aa  65.5  0.0000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4962  thiamineS protein  44.32 
 
 
82 aa  64.7  0.0000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.806952  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4478  thiamineS  47.67 
 
 
88 aa  63.9  0.0000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.605033  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4565  thiamineS protein  47.67 
 
 
88 aa  63.9  0.0000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0626393 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4861  thiamineS protein  47.67 
 
 
88 aa  63.9  0.0000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0539176 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1704  thiamineS protein  48.86 
 
 
82 aa  60.5  0.000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5048  thiamineS protein  46.59 
 
 
88 aa  58.9  0.00000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.501283  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2024  thiamineS protein  48.35 
 
 
92 aa  56.6  0.0000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.930246  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34170  molybdopterin converting factor, small subunit  43.02 
 
 
103 aa  55.1  0.0000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.176144  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1232  thiamine S protein  49.45 
 
 
82 aa  54.7  0.0000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.895224  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0822  thiamineS protein  48.86 
 
 
79 aa  53.9  0.0000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0182275  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10885  molybdenum cofactor biosynthesis protein D 2 moaD2  46.67 
 
 
92 aa  52.4  0.000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  3.91513e-26  normal  0.142298 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08550  ThiS family protein  55.81 
 
 
100 aa  49.3  0.00002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.266586  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2736  putative molybdopterin converting factor  47.78 
 
 
102 aa  48.5  0.00003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1754  thiamineS protein  42.05 
 
 
94 aa  47.4  0.00006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.593582  hitchhiker  0.00626115 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0445  thiamine S  45.05 
 
 
97 aa  47  0.00009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4537  thiamineS protein  43.18 
 
 
98 aa  44.3  0.0006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.708821 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0596  thiamineS protein  45.56 
 
 
84 aa  43.9  0.0007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0454  thiamineS protein  45.56 
 
 
82 aa  43.1  0.001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.132954  normal  0.504318 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4752  thiamineS protein  42.11 
 
 
100 aa  43.1  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3626  thiamineS protein  45.83 
 
 
92 aa  42.4  0.002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.014511  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13354  moaD-moaE fusion protein moaX  34.09 
 
 
221 aa  42.4  0.002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00273279  normal  0.249285 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2368  MoaD family protein  32.95 
 
 
228 aa  40  0.01  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.467874  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>