14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apre_1123 on replicon NC_013171
Organism: Anaerococcus prevotii DSM 20548



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013171  Apre_1123  hypothetical protein  100 
 
 
128 aa  256  1e-67  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000000270021  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0365  hypothetical protein  36.67 
 
 
132 aa  90.9  6e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0368  hypothetical protein  35.83 
 
 
132 aa  87.8  4e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.967507  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1173  protein of unknown function DUF125 transmembrane  30.25 
 
 
293 aa  51.6  0.000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0215  protein of unknown function DUF125 transmembrane  27.36 
 
 
300 aa  51.2  0.000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1685  protein of unknown function DUF125 transmembrane  27.93 
 
 
289 aa  44.3  0.0006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0860  hypothetical protein  31.25 
 
 
293 aa  43.9  0.0007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.110107  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1618  hypothetical protein  27.91 
 
 
376 aa  43.5  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.524945  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5265  hypothetical protein  29.63 
 
 
374 aa  42.7  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.716255  normal  0.0847369 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1049  hypothetical protein  23.33 
 
 
293 aa  42.4  0.002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1196  protein of unknown function DUF125 transmembrane  23.73 
 
 
285 aa  41.6  0.004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.679365 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1809  hypothetical protein  27.59 
 
 
288 aa  41.2  0.005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.305818  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0331  hypothetical protein  25.44 
 
 
287 aa  41.2  0.005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.464299  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01890  uncharacterized membrane protein  27.93 
 
 
297 aa  40.8  0.006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>