11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_5754 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_5754  hypothetical protein  100 
 
 		 243 aa  456  1e-127  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27310  hypothetical protein  58.11 
 
 		 285 aa  92  8e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3253  hypothetical protein  56 
 
 		 276 aa  90.5  2e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.313329  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3431  hypothetical protein  40.6 
 
 		 196 aa  70.9  0.00000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.306907  decreased coverage  0.00685853 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3205  hypothetical protein  44.09 
 
 		 194 aa  58.2  0.0000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.623642 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2918  hypothetical protein  28.98 
 
 		 378 aa  55.1  0.000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000443349  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4003  hypothetical protein  31.76 
 
 		 203 aa  52.4  0.000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1415  hypothetical protein  33.15 
 
 		 604 aa  52.4  0.000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.119038 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2879  hypothetical protein  33.33 
 
 		 632 aa  51.6  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0753  nuclease  38.64 
 
 		 237 aa  47  0.0003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.838035  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2752  beta-lactamase-like protein  23.48 
 
 		 443 aa  43.5  0.003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>