12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_5518 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_5518  hypothetical protein  100 
 
 		 181 aa  366  1e-100  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25910  hypothetical protein  60.36 
 
 		 174 aa  197  7e-50  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2429  protein of unknown function DUF402  50.6 
 
 		 269 aa  135  2e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.65145  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3351  hypothetical protein  50.72 
 
 		 150 aa  131  5e-30  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.935862  normal  0.421522 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11648  hypothetical protein  47.22 
 
 		 147 aa  127  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.615467 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3017  hypothetical protein  44.44 
 
 		 145 aa  121  5e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.116711 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3557  hypothetical protein  48.84 
 
 		 131 aa  118  4.9999999999999996e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.248102 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3002  hypothetical protein  44.12 
 
 		 137 aa  114  5e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3048  hypothetical protein  44.12 
 
 		 137 aa  114  5e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2866  hypothetical protein  39.41 
 
 		 175 aa  105  3e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1277  hypothetical protein  34.97 
 
 		 186 aa  97.4  1e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.919824 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5519  hypothetical protein  26.19 
 
 		 173 aa  63.9  0.000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>