35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_5433 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_5433  hypothetical protein  100 
 
 		 141 aa  265  1e-70  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00625909  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3045  hypothetical protein  47.47 
 
 		 137 aa  74.3  0.0000000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3104  hypothetical protein  47.47 
 
 		 137 aa  74.3  0.0000000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3061  hypothetical protein  47.47 
 
 		 137 aa  73.9  0.0000000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.130056  normal  0.220176 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2821  hypothetical protein  46.94 
 
 		 137 aa  72.4  0.000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.650851  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4717  hypothetical protein  43.96 
 
 		 140 aa  70.5  0.000000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.729727  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11632  hypothetical protein  40.65 
 
 		 132 aa  70.5  0.000000000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.079961 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2011  hypothetical protein  54.41 
 
 		 124 aa  68.9  0.00000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.837589  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3594  hypothetical protein  45.45 
 
 		 136 aa  69.3  0.00000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.32654  normal  0.529723 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2222  hypothetical protein  41.67 
 
 		 150 aa  68.2  0.00000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4905  hypothetical protein  44.23 
 
 		 140 aa  68.2  0.00000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.159227  hitchhiker  0.00546227 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2876  putative transmembrane protein  52.7 
 
 		 142 aa  67  0.00000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000745882  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3029  hypothetical protein  40.34 
 
 		 127 aa  63.9  0.0000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6425  hypothetical protein  39.44 
 
 		 154 aa  63.9  0.0000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0371  hypothetical protein  47.22 
 
 		 145 aa  63.5  0.0000000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.37992e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1449  hypothetical protein  42.57 
 
 		 162 aa  63.5  0.0000000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0129  hypothetical protein  39.84 
 
 		 139 aa  62.4  0.000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0704993  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3698  hypothetical protein  42.67 
 
 		 141 aa  62  0.000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.309374  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2938  hypothetical protein  42.57 
 
 		 145 aa  59.3  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.904567 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0847  hypothetical protein  34.85 
 
 		 170 aa  58.5  0.00000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3177  hypothetical protein  38.14 
 
 		 171 aa  58.2  0.00000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.421028  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5672  hypothetical protein  50 
 
 		 124 aa  52  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1387  hypothetical protein  35.83 
 
 		 200 aa  52.4  0.000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1345  hypothetical protein  37.19 
 
 		 222 aa  51.6  0.000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.405691  decreased coverage  0.0000428453 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1885  hypothetical protein  41.18 
 
 		 139 aa  50.4  0.000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0572068  normal  0.900072 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1163  hypothetical protein  41.43 
 
 		 154 aa  48.1  0.00004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.567834  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0231  hypothetical protein  34.85 
 
 		 114 aa  47.8  0.00005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2234  hypothetical protein  28.68 
 
 		 221 aa  47.8  0.00006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00687189 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14880  hypothetical protein  37.25 
 
 		 155 aa  47  0.00008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0219247  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3461  hypothetical protein  55.56 
 
 		 166 aa  46.6  0.0001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.239912  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1720  hypothetical protein  32.31 
 
 		 130 aa  45.8  0.0002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000883152  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2433  hypothetical protein  42.11 
 
 		 120 aa  43.5  0.0009  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0955395  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27251  hypothetical protein  46.94 
 
 		 126 aa  42.7  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0850  hypothetical protein  28.97 
 
 		 132 aa  40.8  0.007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.407924 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0848  hypothetical protein  39.58 
 
 		 136 aa  40.8  0.007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.276759 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>