23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_1296 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_1296  hypothetical protein  100 
 
 		 80 aa  153  8e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13830  hypothetical protein  75.47 
 
 		 85 aa  82.8  0.000000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.381398  normal  0.46801 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1937  hypothetical protein  60 
 
 		 61 aa  60.1  0.000000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.20896  hitchhiker  0.00316318 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2357  hypothetical protein  47.06 
 
 		 104 aa  56.2  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0767  hypothetical protein  58.7 
 
 		 113 aa  54.7  0.0000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3420  hypothetical protein  42.47 
 
 		 106 aa  54.3  0.0000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.513406  normal  0.271045 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3797  hypothetical protein  41.1 
 
 		 140 aa  53.9  0.0000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00756278 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3183  hypothetical protein  48.98 
 
 		 138 aa  52.4  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0105662  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1677  hypothetical protein  52.17 
 
 		 107 aa  51.6  0.000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.989943  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0871  hypothetical protein  51.02 
 
 		 101 aa  51.2  0.000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.272894  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1190  hypothetical protein  58.14 
 
 		 101 aa  50.1  0.00001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1804  hypothetical protein  46.3 
 
 		 111 aa  48.1  0.00004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.45464  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0807  secreted protein  46.81 
 
 		 110 aa  47.4  0.00007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0257715 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1316  hypothetical protein  57.14 
 
 		 92 aa  47  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.342241  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2724  hypothetical protein  41.82 
 
 		 87 aa  45.4  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.264788  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3221  hypothetical protein  45.65 
 
 		 113 aa  45.4  0.0003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0124684  normal  0.80653 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3451  hypothetical protein  43.4 
 
 		 81 aa  44.3  0.0006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.296406 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3503  hypothetical protein  43.4 
 
 		 81 aa  44.3  0.0006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.138277  normal  0.495612 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3440  hypothetical protein  43.4 
 
 		 81 aa  44.3  0.0006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.110215  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0934  hypothetical protein  51.22 
 
 		 88 aa  43.1  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.860281  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26160  hypothetical protein  39.58 
 
 		 128 aa  42.7  0.002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3812  hypothetical protein  41.51 
 
 		 99 aa  41.6  0.003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.285278  normal  0.456235 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1041  hypothetical protein  52.17 
 
 		 486 aa  40.8  0.006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>