18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_1075 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_1075  hypothetical protein  100 
 
 		 286 aa  574  1.0000000000000001e-163  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5307  hypothetical protein  48.48 
 
 		 299 aa  246  3e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.522562  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5087  hypothetical protein  41.44 
 
 		 296 aa  201  9.999999999999999e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.692279 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3163  hypothetical protein  39.93 
 
 		 302 aa  190  2.9999999999999997e-47  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  decreased coverage  0.0045094  normal  0.153591 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1177  hypothetical protein  39.31 
 
 		 305 aa  171  1e-41  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.11643  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6450  hypothetical protein  37.98 
 
 		 290 aa  169  4e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0170653 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4541  hypothetical protein  39.74 
 
 		 304 aa  167  2e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6168  hypothetical protein  39.24 
 
 		 291 aa  157  1e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.132354  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0562  hypothetical protein  38.41 
 
 		 294 aa  155  8e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0282  hypothetical protein  38.18 
 
 		 294 aa  152  8e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.770282 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11170  hypothetical protein  36.61 
 
 		 301 aa  146  4.0000000000000006e-34  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0898011 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3276  hypothetical protein  33.56 
 
 		 298 aa  135  9.999999999999999e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.928112  normal  0.235681 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13860  hypothetical protein  31.62 
 
 		 286 aa  134  1.9999999999999998e-30  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0531  hypothetical protein  22.29 
 
 		 306 aa  79.3  0.00000000000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2209  hypothetical protein  24.6 
 
 		 314 aa  70.1  0.00000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000355617  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2014  hypothetical protein  22.61 
 
 		 314 aa  64.7  0.000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1564  hypothetical protein  47.83 
 
 		 332 aa  57.4  0.0000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.234397  normal  0.812381 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2159  hypothetical protein  26.02 
 
 		 313 aa  45.4  0.001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.290579  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>