20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_0779 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013093  Amir_0779  hypothetical protein  100 
 
 
191 aa  365  1e-100  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06340  hypothetical protein  70.97 
 
 
104 aa  139  1.9999999999999998e-32  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2146  hypothetical protein  52.75 
 
 
126 aa  106  2e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00360758  hitchhiker  0.00871202 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1171  DivIVA domain protein  56.98 
 
 
106 aa  93.6  2e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3309  DivIVA domain protein  54.26 
 
 
148 aa  85.1  6e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11233  hypothetical protein  52.27 
 
 
122 aa  79.7  0.00000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.155825  normal  0.0761739 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2188  hypothetical protein  52.78 
 
 
121 aa  76.3  0.0000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.543165  normal  0.744038 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4507  hypothetical protein  52.78 
 
 
122 aa  75.5  0.0000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4004  hypothetical protein  54.69 
 
 
103 aa  69.3  0.00000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0130375  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4078  hypothetical protein  54.69 
 
 
103 aa  69.3  0.00000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.116498  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4234  hypothetical protein  54.69 
 
 
103 aa  69.3  0.00000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.326138 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1095  DivIVA domain protein  48.57 
 
 
125 aa  66.2  0.0000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.423164  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3838  hypothetical protein  47.76 
 
 
140 aa  56.2  0.0000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0245433 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0650  hypothetical protein  34 
 
 
167 aa  48.9  0.00004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.192275  hitchhiker  0.00213419 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3020  hypothetical protein  40 
 
 
136 aa  48.1  0.00007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19450  hypothetical protein  42.42 
 
 
99 aa  47.4  0.0001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.735309  normal  0.0185539 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0497  hypothetical protein  34 
 
 
174 aa  47.4  0.0001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0878  hypothetical protein  41.79 
 
 
206 aa  47  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.123512 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0698  hypothetical protein  33.33 
 
 
141 aa  46.2  0.0003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1202  hypothetical protein  41.56 
 
 
100 aa  44.3  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>