53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_4003 on replicon NC_008782
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008782  Ajs_4003  hypothetical protein  100 
 
 		 784 aa  1585    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.677429 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5117  protein of unknown function DUF1631  47.99 
 
 		 804 aa  647    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3353  hypothetical protein  99.62 
 
 		 784 aa  1580    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.739095  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0836  hypothetical protein  54.99 
 
 		 801 aa  772    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4085  hypothetical protein  60.89 
 
 		 784 aa  897    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0688006  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3883  hypothetical protein  49.75 
 
 		 780 aa  690    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.428838  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4642  hypothetical protein  63.34 
 
 		 795 aa  927    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3864  hypothetical protein  53.42 
 
 		 790 aa  753    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4643  hypothetical protein  61.69 
 
 		 810 aa  621  1e-176  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.43497  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0346  hypothetical protein  38.89 
 
 		 850 aa  482  1e-134  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.198379 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0279  hypothetical protein  40.42 
 
 		 773 aa  465  1e-129  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0968275 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2129  hypothetical protein  24.69 
 
 		 744 aa  110  8.000000000000001e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.796066  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2314  hypothetical protein  25.93 
 
 		 735 aa  105  4e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1435  hypothetical protein  24.62 
 
 		 771 aa  102  2e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1247  hypothetical protein  25.27 
 
 		 782 aa  97.4  9e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2114  hypothetical protein  25.09 
 
 		 787 aa  96.7  1e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.190473  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0751  hypothetical protein  27.11 
 
 		 763 aa  92.4  3e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.567279 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4133  hypothetical protein  26.23 
 
 		 687 aa  91.7  5e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0847  hypothetical protein  27.41 
 
 		 890 aa  90.1  1e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.591232  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2241  hypothetical protein  23.43 
 
 		 782 aa  87  0.000000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0779  hypothetical protein  26.05 
 
 		 766 aa  87  0.000000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0786  hypothetical protein  26.27 
 
 		 729 aa  84.7  0.000000000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.341709 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0429  hypothetical protein  23.61 
 
 		 727 aa  84.3  0.000000000000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.9239 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2170  hypothetical protein  25.34 
 
 		 737 aa  84.7  0.000000000000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0764  hypothetical protein  26.57 
 
 		 781 aa  83.6  0.00000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0949  hypothetical protein  26.03 
 
 		 751 aa  83.2  0.00000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0816  hypothetical protein  26.02 
 
 		 751 aa  83.2  0.00000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.229432 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0699  protein of unknown function DUF1631  24.04 
 
 		 773 aa  82.8  0.00000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.268383  normal  0.290029 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0811  hypothetical protein  24.6 
 
 		 717 aa  82.4  0.00000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.083655  normal  0.106889 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4406  hypothetical protein  25.07 
 
 		 721 aa  80.5  0.0000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.117254  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0875  hypothetical protein  24.21 
 
 		 842 aa  80.5  0.0000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0738842 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0953  hypothetical protein  20.94 
 
 		 766 aa  79.3  0.0000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0596872  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58690  hypothetical protein  24.02 
 
 		 751 aa  79.7  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.544037 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4528  hypothetical protein  25.97 
 
 		 854 aa  79.7  0.0000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.134152  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0820  cell division protein FtsZ  21.21 
 
 		 764 aa  79.3  0.0000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0125442  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0788  hypothetical protein  25.31 
 
 		 745 aa  78.6  0.0000000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5140  hypothetical protein  25 
 
 		 749 aa  77  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4760  hypothetical protein  23.5 
 
 		 447 aa  75.5  0.000000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.22061  normal  0.681724 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3053  hypothetical protein  24.53 
 
 		 732 aa  73.2  0.00000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0822  hypothetical protein  24.4 
 
 		 719 aa  71.2  0.00000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04577  hypothetical protein  22.95 
 
 		 763 aa  69.3  0.0000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2904  hypothetical protein  26.04 
 
 		 867 aa  63.5  0.00000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.011022 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1802  hypothetical protein  25.6 
 
 		 747 aa  58.5  0.0000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.196203 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02373  hypothetical protein  24.07 
 
 		 802 aa  57.8  0.0000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0761  hypothetical protein  22.84 
 
 		 828 aa  57.8  0.0000008  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0851  hypothetical protein  20.88 
 
 		 445 aa  57.4  0.0000009  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.509842  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0848  hypothetical protein  23.88 
 
 		 824 aa  57  0.000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0969  hypothetical protein  20.59 
 
 		 445 aa  56.2  0.000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.852631  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3555  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  24.42 
 
 		 1249 aa  55.8  0.000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2229  hypothetical protein  25.13 
 
 		 1201 aa  53.9  0.00001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.186545  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1201  hypothetical protein  22.36 
 
 		 742 aa  48.5  0.0005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2607  hypothetical protein  22.36 
 
 		 741 aa  47.4  0.001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.978979  normal  0.181183 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2151  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  23.16 
 
 		 1072 aa  45.8  0.003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.439713  normal  0.242332 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>