14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_3600 on replicon NC_008782
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008758  Pnap_4443  hypothetical protein  54.75 
 
 		 946 aa  929    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.67216 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3600  hypothetical protein  100 
 
 		 917 aa  1840    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.619683  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1265  hypothetical protein  48.25 
 
 		 930 aa  868    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0853  hypothetical protein  28.8 
 
 		 939 aa  319  2e-85  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.955255  normal  0.455632 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0725  hypothetical protein  29.21 
 
 		 943 aa  318  4e-85  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0988  hypothetical protein  28.82 
 
 		 939 aa  317  7e-85  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0693  hypothetical protein  29.1 
 
 		 943 aa  316  9.999999999999999e-85  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4492  hypothetical protein  28.62 
 
 		 943 aa  309  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.104208  normal  0.384908 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0725  hypothetical protein  28.92 
 
 		 931 aa  308  3e-82  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.234554  normal  0.0506019 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0979  hypothetical protein  27.96 
 
 		 943 aa  305  4.0000000000000003e-81  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00111519 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4779  hypothetical protein  28.14 
 
 		 946 aa  303  1e-80  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0812122 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61990  hypothetical protein  27.88 
 
 		 948 aa  298  4e-79  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0499759 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5393  hypothetical protein  27.82 
 
 		 948 aa  294  4e-78  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.200983  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2188  hypothetical protein  26.88 
 
 		 1003 aa  48.5  0.0006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>