35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_2194 on replicon NC_008782
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008782  Ajs_2194  hypothetical protein  100 
 
 
119 aa  230  4.0000000000000004e-60  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0956  hypothetical protein  85.12 
 
 
121 aa  201  4e-51  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2386  hypothetical protein  82.24 
 
 
115 aa  165  2e-40  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0675  hypothetical protein  76.74 
 
 
128 aa  131  3e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2851  plasmid conserved hypothetical protein RAQPRD  62.82 
 
 
116 aa  103  6e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.410832  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1264  hypothetical protein  51.89 
 
 
127 aa  88.2  3e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2345  hypothetical protein  50 
 
 
127 aa  87.8  5e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000024781  unclonable  0.000000135076 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4507  hypothetical protein  44.21 
 
 
112 aa  84.7  4e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3416  hypothetical protein  52.13 
 
 
127 aa  84  6e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.199537  normal  0.0728248 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59860  putative type III effector Hop protein  45.26 
 
 
119 aa  84  7e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0114799  hitchhiker  0.000000000000152109 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1406  putative secreted protein  48.57 
 
 
126 aa  83.6  8e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0449246  normal  0.883784 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0510  hypothetical protein  50 
 
 
125 aa  83.2  0.000000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1172  plasmid conserved hypothetical protein RAQPRD  46.23 
 
 
126 aa  82.8  0.000000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4171  hypothetical protein  50 
 
 
127 aa  79.7  0.00000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0787775  normal  0.908625 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1450  hypothetical protein  42.86 
 
 
120 aa  79.3  0.00000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.176876 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3015  hypothetical protein  45.16 
 
 
111 aa  78.6  0.00000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1192  hypothetical protein  47.06 
 
 
127 aa  78.6  0.00000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0476297  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2940  hypothetical protein  46.32 
 
 
119 aa  76.6  0.0000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0443  hypothetical protein  42.59 
 
 
125 aa  74.3  0.0000000000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0869  hypothetical protein  41.35 
 
 
121 aa  74.3  0.0000000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1634  hypothetical protein  43.14 
 
 
126 aa  72.8  0.000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36200  Plasmid hypothetical protein, RAQPRD  43.16 
 
 
118 aa  73.2  0.000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1975  hypothetical protein  45.45 
 
 
106 aa  70.9  0.000000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.793487  normal  0.0588068 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3322  hypothetical protein  44.21 
 
 
111 aa  68.2  0.00000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.840275  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4094  hypothetical protein  45.68 
 
 
109 aa  63.9  0.0000000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4177  hypothetical protein  45.68 
 
 
109 aa  63.5  0.0000000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0329  hypothetical protein  45.68 
 
 
110 aa  63.2  0.000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.132936 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0368  hypothetical protein  56.25 
 
 
203 aa  60.1  0.00000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3713  hypothetical protein  35.92 
 
 
102 aa  58.5  0.00000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0652  hypothetical protein  36.54 
 
 
102 aa  56.6  0.0000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1756  hypothetical protein  39.39 
 
 
107 aa  55.1  0.0000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0640  hypothetical protein  37.76 
 
 
100 aa  54.3  0.0000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0682  hypothetical protein  37.37 
 
 
100 aa  52.4  0.000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.15011  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4944  hypothetical protein  51.52 
 
 
315 aa  52.8  0.000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2762  hypothetical protein  30 
 
 
103 aa  43.1  0.001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.294912  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>