36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_1406 on replicon NC_008782
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008782  Ajs_1406  putative secreted protein  100 
 
 		 126 aa  245  2e-64  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0449246  normal  0.883784 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1172  plasmid conserved hypothetical protein RAQPRD  90.55 
 
 		 126 aa  219  7e-57  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2345  hypothetical protein  86.51 
 
 		 127 aa  209  1e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000024781  unclonable  0.000000135076 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1264  hypothetical protein  84.92 
 
 		 127 aa  204  3e-52  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3416  hypothetical protein  82.68 
 
 		 127 aa  202  1e-51  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.199537  normal  0.0728248 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4171  hypothetical protein  82.68 
 
 		 127 aa  202  2e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0787775  normal  0.908625 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1192  hypothetical protein  80.31 
 
 		 127 aa  195  2.0000000000000003e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0476297  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1634  hypothetical protein  61.61 
 
 		 126 aa  130  5e-30  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0443  hypothetical protein  57.8 
 
 		 125 aa  120  7e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3015  hypothetical protein  43.27 
 
 		 111 aa  87  7e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59860  putative type III effector Hop protein  48.39 
 
 		 119 aa  87  9e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0114799  hitchhiker  0.000000000000152109 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0869  hypothetical protein  43.56 
 
 		 121 aa  86.7  1e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2386  hypothetical protein  50 
 
 		 115 aa  84  7e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2194  hypothetical protein  48.57 
 
 		 119 aa  83.6  8e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1450  hypothetical protein  42.57 
 
 		 120 aa  83.6  9e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.176876 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4507  hypothetical protein  47.31 
 
 		 112 aa  83.6  0.000000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0956  hypothetical protein  49.06 
 
 		 121 aa  83.2  0.000000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2851  plasmid conserved hypothetical protein RAQPRD  49.37 
 
 		 116 aa  78.6  0.00000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.410832  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36200  Plasmid hypothetical protein, RAQPRD  49.4 
 
 		 118 aa  77.8  0.00000000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0675  hypothetical protein  54.02 
 
 		 128 aa  75.5  0.0000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2940  hypothetical protein  48.81 
 
 		 119 aa  69.7  0.00000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3322  hypothetical protein  50 
 
 		 111 aa  70.1  0.00000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.840275  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1975  hypothetical protein  50 
 
 		 106 aa  69.3  0.00000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.793487  normal  0.0588068 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0510  hypothetical protein  44.55 
 
 		 125 aa  68.6  0.00000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4094  hypothetical protein  47.56 
 
 		 109 aa  64.7  0.0000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4177  hypothetical protein  47.56 
 
 		 109 aa  64.3  0.0000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0329  hypothetical protein  44.94 
 
 		 110 aa  62  0.000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.132936 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0368  hypothetical protein  48.48 
 
 		 203 aa  60.1  0.00000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0652  hypothetical protein  33.33 
 
 		 102 aa  54.3  0.0000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3713  hypothetical protein  33.33 
 
 		 102 aa  53.9  0.0000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1756  hypothetical protein  33.71 
 
 		 107 aa  51.2  0.000005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0640  hypothetical protein  35.14 
 
 		 100 aa  47.4  0.00008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0682  hypothetical protein  37.63 
 
 		 100 aa  45.1  0.0003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.15011  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0919  hypothetical protein  34.15 
 
 		 276 aa  42  0.003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.40379  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3933  hypothetical protein  40 
 
 		 102 aa  41.2  0.005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2762  hypothetical protein  35.05 
 
 		 103 aa  40.4  0.008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.294912  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>