16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Afer_1165 on replicon NC_013124
Organism: Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013124  Afer_1165    100 
 
 
905 bp  1794    Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1634    85.92 
 
 
1113 bp  682    Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1654  hypothetical protein  84.71 
 
 
1023 bp  563  1e-158  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.696062  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1892    82.75 
 
 
3611 bp  412  1e-113  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1895    82.75 
 
 
1291 bp  412  1e-113  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1312    85.92 
 
 
965 bp  107  6e-21  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.293835  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1655  hypothetical protein  94.74 
 
 
270 bp  81.8  0.0000000000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.549221  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0547    93.62 
 
 
420 bp  61.9  0.0000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1573    87.84 
 
 
1271 bp  60  0.000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0375  transposase mutator type  87.67 
 
 
1233 bp  58  0.000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0545422  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1859  transposase mutator type  87.67 
 
 
1233 bp  58  0.000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2636  transposase mutator type  87.67 
 
 
1233 bp  58  0.000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2905  transposase mutator type  87.67 
 
 
1233 bp  58  0.000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0550  transposase, mutator type  90.91 
 
 
1233 bp  48.1  0.004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.874043 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0581  transposase, mutator type  90.91 
 
 
1233 bp  48.1  0.004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0585  transposase, mutator type  90.91 
 
 
1233 bp  48.1  0.004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.390159  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>