36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeh_0345 on replicon NC_007760
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007760  Adeh_0345  hypothetical protein  100 
 
 
416 aa  721    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0374  hypothetical protein  89.97 
 
 
414 aa  446  1.0000000000000001e-124  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.103729  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0361  hypothetical protein  90.48 
 
 
415 aa  444  1e-123  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0254485  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4115  hypothetical protein  60.1 
 
 
406 aa  358  7e-98  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2054  hypothetical protein  58.78 
 
 
406 aa  336  5e-91  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.594988  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2553  hypothetical protein  59.8 
 
 
406 aa  336  5.999999999999999e-91  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0543  hypothetical protein  56.82 
 
 
406 aa  333  3e-90  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.939754  normal  0.330299 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6465  hypothetical protein  55.05 
 
 
406 aa  330  2e-89  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.645 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2341  hypothetical protein  57.32 
 
 
406 aa  330  2e-89  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.159022 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1896  hypothetical protein  57.25 
 
 
406 aa  324  2e-87  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0992  tetratricopeptide TPR_4  56.61 
 
 
406 aa  324  2e-87  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4057  helix-turn-helix type 11 domain-containing protein  54.48 
 
 
406 aa  321  9.999999999999999e-87  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1331  putative transcriptional regulator, CadC  53.77 
 
 
406 aa  321  1.9999999999999998e-86  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.900244  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5692  hypothetical protein  52.42 
 
 
406 aa  319  6e-86  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2027  hypothetical protein  57.25 
 
 
406 aa  318  1e-85  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.402308  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3200  TPR repeat-containing protein  60.29 
 
 
406 aa  317  2e-85  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6083  helix-turn-helix, type 11  57.21 
 
 
406 aa  317  3e-85  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.92562  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1994  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  57.21 
 
 
406 aa  317  3e-85  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.739767  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3202  hypothetical protein  55.33 
 
 
407 aa  317  3e-85  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.480784  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2671  hypothetical protein  55.33 
 
 
406 aa  316  5e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0727774  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1312  hypothetical protein  55.73 
 
 
406 aa  314  1.9999999999999998e-84  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0250798  normal  0.495238 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0024  hypothetical protein  58.06 
 
 
406 aa  313  4.999999999999999e-84  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.199967 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2014  hypothetical protein  56.72 
 
 
406 aa  311  2e-83  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.641848  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0354  hypothetical protein  52 
 
 
413 aa  309  5e-83  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.856052  normal  0.784045 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5304  hypothetical protein  56.48 
 
 
406 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.967801  normal  0.137738 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6319  Tetratricopeptide TPR_4  58.59 
 
 
406 aa  304  1.0000000000000001e-81  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3285  hypothetical protein  57.88 
 
 
367 aa  300  3e-80  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0105724  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2027  peptidase cysteine peptidase active site  57.88 
 
 
367 aa  300  3e-80  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.986285  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1376  hypothetical protein  55.56 
 
 
406 aa  294  2e-78  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.379564  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0081  tetratricopeptide TPR_4  58.72 
 
 
408 aa  291  2e-77  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1282  hypothetical protein  56.33 
 
 
406 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0406727  normal  0.439874 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6460  hypothetical protein  51.66 
 
 
406 aa  285  1.0000000000000001e-75  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.678731  normal  0.843647 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3151  tetratricopeptide TPR_4  55.64 
 
 
419 aa  264  3e-69  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4849  tetratricopeptide TPR_4  55.47 
 
 
407 aa  251  2e-65  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2358  hypothetical protein  56.13 
 
 
414 aa  238  2e-61  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.634476  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3607  hypothetical protein  58.25 
 
 
421 aa  220  3e-56  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0764463 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>