13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_3947 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008009  Acid345_3947  hypothetical protein  100 
 
 		 467 aa  963    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.917121  normal  0.453465 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3797  hypothetical protein  45.41 
 
 		 471 aa  323  4e-87  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.533548  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1668  hypothetical protein  38.3 
 
 		 481 aa  230  3e-59  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5589  hypothetical protein  30.55 
 
 		 491 aa  176  9.999999999999999e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2664  hypothetical protein  26.51 
 
 		 975 aa  91.3  3e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.0000000490986  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0556  Carbohydrate-binding CenC domain protein  29.3 
 
 		 857 aa  75.9  0.000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4459  hypothetical protein  25 
 
 		 778 aa  73.2  0.00000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3349  hypothetical protein  23.44 
 
 		 559 aa  57.4  0.0000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0160  hypothetical protein  24.59 
 
 		 600 aa  56.2  0.000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3143  periplasmic copper-binding  26.28 
 
 		 452 aa  45.1  0.002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0816  hypothetical protein  24.58 
 
 		 556 aa  44.3  0.004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0947814 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6009  copper ABC transporter, periplasmic binding protein NosD  34.48 
 
 		 462 aa  43.9  0.006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0148833  normal  0.0830201 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0429  periplasmic copper-binding  28.03 
 
 		 454 aa  43.5  0.008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>