14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_3177 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008009  Acid345_3177  hypothetical protein  100 
 
 
146 aa  303  5.0000000000000004e-82  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3592  hypothetical protein  46.51 
 
 
146 aa  107  6e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1551  hypothetical protein  42.57 
 
 
130 aa  99.8  1e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.646726  normal 
 
 
-
 
NC_009829  Spro_4940  hypothetical protein  37.8 
 
 
173 aa  82  0.000000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000000844553  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3107  hypothetical protein  36.3 
 
 
157 aa  65.5  0.0000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000543353  decreased coverage  0.0000114562 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3389  hypothetical protein  36.84 
 
 
165 aa  62.8  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.248941  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0329  hypothetical protein  31.3 
 
 
130 aa  60.5  0.000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00304499  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3017  hypothetical protein  36.15 
 
 
136 aa  58.5  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.196092  normal  0.052376 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1518  hypothetical protein  26.76 
 
 
151 aa  52.8  0.000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00559169 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3755  hypothetical protein  28.37 
 
 
226 aa  47.4  0.00006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.473381  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6261  hypothetical protein  40.43 
 
 
160 aa  45.1  0.0003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1753  hypothetical protein  51.28 
 
 
149 aa  45.1  0.0004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.522125  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3865  hypothetical protein  32.03 
 
 
236 aa  43.5  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0127474 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3920  hypothetical protein  29.93 
 
 
137 aa  41.2  0.004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.879955  normal  0.416027 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>