16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acel_0750 on replicon NC_008578
Organism: Acidothermus cellulolyticus 11B



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008578  Acel_0750  rod shape-determining protein MreD  100 
 
 		 171 aa  313  6e-85  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.276386  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1541  rod shape-determining protein MreD  44.67 
 
 		 193 aa  106  1e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.110151  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7280  hypothetical protein  41.07 
 
 		 176 aa  92.8  2e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.283498 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1213  rod shape-determining protein  46.96 
 
 		 180 aa  80.5  0.00000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5267  putative rod shape-determining protein MreD; putative membrane protein  45.07 
 
 		 178 aa  77  0.0000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.396578 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3463  rod shape-determining protein  43.06 
 
 		 170 aa  75.1  0.0000000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0895457  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7283  rod shape-determining protein MreD  39.35 
 
 		 193 aa  71.2  0.000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0851  rod shape-determining protein MreD  46.05 
 
 		 173 aa  62.8  0.000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.161831 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2466  rod shape-determining protein MreD  48.21 
 
 		 170 aa  56.6  0.0000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.201229 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1639  hypothetical protein  32.35 
 
 		 167 aa  50.8  0.000009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000014307  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2546  hypothetical protein  36.46 
 
 		 166 aa  48.9  0.00004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3337  rod shape-determining protein MreD  37.23 
 
 		 166 aa  46.6  0.0002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00122774  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2220  rod shape-determining protein MreD  39.33 
 
 		 166 aa  45.4  0.0003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0539  hypothetical protein  41.33 
 
 		 169 aa  44.3  0.0008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.591389 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1538  rod shape-determining protein MreD  36.36 
 
 		 163 aa  43.9  0.001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.207887  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1464  hypothetical protein  32.17 
 
 		 164 aa  42  0.004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>