16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_0487 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008752  Aave_0487  hypothetical protein  100 
 
 
123 aa  237  4e-62  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2865  hypothetical protein  40.4 
 
 
114 aa  79  0.00000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0689  hypothetical protein  39.13 
 
 
117 aa  75.5  0.0000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.293413  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3430  hypothetical protein  44.71 
 
 
119 aa  71.2  0.000000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.692072  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2180  hypothetical protein  39.36 
 
 
117 aa  66.2  0.0000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2400  hypothetical protein  39.36 
 
 
117 aa  65.9  0.0000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0942  hypothetical protein  39.36 
 
 
117 aa  63.2  0.000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4185  hypothetical protein  37.07 
 
 
123 aa  60.8  0.000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.295357  normal  0.923646 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1392  hypothetical protein  44.74 
 
 
123 aa  60.5  0.000000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1427  hypothetical protein  34.21 
 
 
124 aa  56.2  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.273174  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1178  hypothetical protein  40.58 
 
 
119 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1250  hypothetical protein  39.13 
 
 
119 aa  52.8  0.000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.64144  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2359  hypothetical protein  38.46 
 
 
118 aa  50.1  0.00001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000000686199  unclonable  0.000000113838 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0429  hypothetical protein  40.38 
 
 
116 aa  50.1  0.00001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.697618  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1619  hypothetical protein  33.33 
 
 
116 aa  49.7  0.00001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0847  hypothetical protein  43.59 
 
 
122 aa  43.5  0.0009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>